永元元年（己卯年，公元499年）
春季，正月初一（戊寅日），朝廷宣布大赦天下，更改年号为永元。
太尉陈显达统领平北将军崔慧景等人的四万大军进攻北魏，想要收复雍州各郡；正月初六（癸未日），北魏派遣前将军元英率军抵抗。
正月初八（乙酉日），北魏孝文帝从邺城出发返回洛阳。
正月十四（辛卯日），南齐皇帝萧宝卷到南郊祭祀天神。
正月二十一（戊戌日），孝文帝抵达洛阳，途中经过李冲的府第。当时李冲正卧病在床，孝文帝远远望见他的府门，不禁落泪；接见洛阳留守官员时，每当谈到李冲，孝文帝总会流下眼泪。
孝文帝对任城王元澄说：“我离开京城以来，旧的习俗有没有稍微改变？”元澄回答：“陛下的教化让京城日益更新。”孝文帝说：“我进城时，还看见车上的妇人仍戴着帽子、穿着小袄（这是北魏旧俗服饰），怎能说‘日益更新’！”元澄辩解：“穿旧服饰的人少，不穿的人多。”孝文帝斥责道：“任城王，你这说的是什么话！难道非要让全城人都不穿旧服饰才算吗！”元澄和留守官员都脱下官帽请罪。
正月二十七（甲辰日），北魏宣布大赦。此前孝文帝前往邺城时，李彪曾在邺城南郊迎接拜见，并为过去的过错请罪。孝文帝当时说：“我本想任用你，但因李仆射（李冲）的缘故才作罢。”随后安慰了李彪，让他回去。不久，御史台令史龙文观告发：“太子元恂被逮捕时，曾亲手写信为自己申辩，李彪却没有把这封信上报。”尚书省上奏请求将李彪押解到洛阳审问。孝文帝认为李彪不会这么做，便让李彪坐着牛车（未经捆绑）前往洛阳，恰逢大赦，李彪得以赦免罪责。
北魏太保、齐郡灵王元简去世。
二月初五（辛亥日），北魏任命咸阳王元禧为太尉。
孝文帝连年在外征战，冯皇后（幽皇后）暗中与宦官高菩萨私通。等到孝文帝在悬瓠病重时，冯皇后更加毫无顾忌，中常侍双蒙等人成为她的心腹。
彭城公主是宋王刘昶的儿媳，此时已守寡。冯皇后想让自己的同母弟弟北平公冯夙娶彭城公主，孝文帝同意了这门婚事；但彭城公主不愿意，冯皇后却强迫她出嫁。彭城公主秘密带着家仆冒雨前往悬瓠，向孝文帝哭诉此事，还详细揭发了冯皇后的所作所为。孝文帝心中怀疑，却暂时隐瞒了这件事。冯皇后得知后，才开始害怕，暗中与母亲常氏让女巫搞“厌祷”（一种诅咒他人的巫术），并对女巫说：“如果皇帝的病治不好，我一旦能像文明太后那样辅佐年幼的君主临朝执政，一定会重赏你，让你享尽富贵。”
孝文帝返回洛阳后，立即逮捕了高菩萨、双蒙等人，经过审问，他们全部招供。孝文帝在含温室过夜时，召冯皇后入宫，让她坐在东边的柱子旁，距离自己的床榻有两丈多远，命令高菩萨等人当面陈述与冯皇后的私情。随后又召彭城王元勰、北海王元详入宫，对他们说：“她过去是你们的嫂子，现在是与你们无关的路人，你们进来不用回避她！”又说：“这个女人想亲手用刀刺我的肋部！我看在她是文明太后家族女子的份上，没有废黜她，只是把她空置于宫中，希望她能自己了断；你们不要以为我对她还有情意。”元勰、元详退出后，孝文帝让冯皇后与他们诀别；冯皇后跪拜磕头，流泪不止，之后被送入后宫居住。其他妃嫔仍然按照皇后的礼仪侍奉她，只是下令太子不再向她朝拜而已。
起初，冯熙（文明太后的哥哥）娶了恭宗（北魏景穆帝拓跋晃，孝文帝祖父）的女儿博陵长公主。冯熙有三个女儿，两个成为皇后（冯废后、冯幽后），一个成为左昭仪，因此冯氏家族的尊贵与宠信在群臣中无人能及，获得的赏赐累计达数万之多。博陵长公主生下两个儿子：冯诞、冯修。冯熙官至太保，冯诞官至司徒，冯修任侍中、尚书，冯熙的庶子冯聿任黄门郎。黄门侍郎崔光与冯聿一同在宫中当值，曾对冯聿说：“你家富贵到了极点，最终一定会衰败。”冯聿反驳：“我家从未做过亏心事，你为什么要毫无根据地诅咒我！”崔光说：“不是我诅咒你。事物发展到极致就一定会走向衰败，这是天地间的常理。如果用古代的事例推算，你家不能不谨慎啊。”过了一年多，冯修就出事了。冯修性格浮躁好胜，冯诞多次告诫他，他却不知悔改，冯诞只好向文明太后和孝文帝报告，孝文帝下令杖打冯修。冯修因此怨恨冯诞，就找毒药，让冯诞身边的人毒杀冯诞。事情败露后，孝文帝想处死冯修，冯诞却主动承担责任，恳切请求饶冯修一命。孝文帝也考虑到冯熙年老，只杖打了冯修一百多下，将他贬为平城的普通百姓。后来冯诞、冯熙相继去世，不久冯皇后被废黜，冯聿也被朝廷弃用，冯氏家族就此衰败。
二月十七（癸亥日），北魏任命彭城王元勰为司徒。
陈显达与北魏元英交战，多次击败元英的军队。陈显达围攻马圈城四十天，城中粮食耗尽，守军只能吃死人肉和树皮。二月二十七（癸酉日），北魏守军突围逃跑，陈显达的军队斩杀、俘虏了上千人。陈显达进入马圈城后，将士们争相抢夺城中的绢帛，没有追击逃跑的魏军。陈显达又派遣军主庄丘黑进攻南乡，成功攻克。
孝文帝对任城王元澄说：“陈显达侵扰我国边境，我如果不亲自出征，就无法制服他。”三月初四（庚辰日），孝文帝从洛阳出发，命令于烈留守洛阳，任命右卫将军宋弁兼任祠部尚书，代理“七兵事”（掌管军事的官职），辅佐于烈。宋弁处理政务精细勤勉，孝文帝对他的恩宠礼遇仅次于李冲。
三月初七（癸未日），孝文帝抵达梁城。崔慧景正在进攻北魏的顺阳，顺阳太守、清河人张烈坚守城池；三月初八（甲申日），孝文帝派遣振威将军慕容平城率领五千骑兵前去救援顺阳。
自从孝文帝生病以来，彭城王元勰一直留在宫中侍奉他服药治病，昼夜不离左右，孝文帝的饮食他一定先尝过再端给孝文帝，自己则头发散乱、满脸污垢，连衣服都不脱就睡觉。孝文帝因长期生病，性情变得暴躁易怒，身边侍从稍有不慎，动辄就会被下令处死。元勰总是顺着孝文帝的心意，寻找合适的时机劝谏，挽救了很多人的性命。
三月初十（丙戌日），孝文帝任命元勰为使持节、都督中外诸军事（掌管全国军队）。元勰推辞说：“我侍奉陛下治病都忙不过来，怎能再治理军队！希望陛下另选一位亲王，让他总管军事，我才能专心照料陛下的病情。”孝文帝说：“侍奉我治病、治理军队，都要依靠你。我的病已经到了这个地步，很担心活不了多久；安定全军、保住国家，除了你还能有谁！你怎么能再请别人接替，违背我托付的心意呢！”
三月二十一（丁酉日），孝文帝抵达马圈城，命令荆州刺史、广阳王元嘉扼守均口，阻断南齐军队的退路。元嘉是元建的儿子。
陈显达率领军队渡过均水向西进军，占据鹰子山修筑营垒；军中士兵情绪沮丧、心怀恐惧，与魏军交战，多次战败。北魏武卫将军元嵩摘下头盔冲锋陷阵，将士们紧随其后，南齐军队大败。元嵩是元澄的弟弟。
三月二十二（戊戌日）夜里，军主崔恭祖、胡松用黑色布幔裹住陈显达，几个人抬着他，从小路经分碛山逃出均水口，向南撤退。三月二十三（己亥日），魏军缴获了陈显达军队的物资，数量以亿计算，孝文帝将这些物资分赏给将士，又追击南齐军队到汉水才返回。南齐左军将军张千战死，士兵死亡的有三万多人。
陈显达北伐时，军队曾进入汋均口。广平人冯道根劝陈显达说：“汋均水水流湍急，军队前进容易、后退困难；如果北魏军队守住险要关口，我们的军队就会首尾受困。不如把船只全部丢弃在酂城，从陆路徒步前进，让各营依次排列，大张旗鼓地进军，一定能打败魏军。”陈显达没有听从。冯道根带着自己的家丁随军出征，等到陈显达夜里撤退时，士兵们不熟悉山路，冯道根每次走到险要之处，就停下马为大家指明道路，众人依靠他才得以保全性命。朝廷下诏任命冯道根为汋均口戍副。陈显达一向有威名，经过这次战败，威名大损。御史中丞范岫上奏请求罢免陈显达的官职，陈显达也自己上表请求辞职；朝廷都没有同意，反而任命陈显达为江州刺史。崔慧景也放弃顺阳，撤兵返回南齐。
三月二十四（庚子日），孝文帝病情加重，决定向北返回洛阳，到达谷塘原时，对司徒元勰说：“后宫的冯皇后长期违背妇德，我死后，可以赐她自尽，用皇后的礼仪安葬她，这样或许能避免冯氏家族的丑名传开。”又说：“我的病越来越重，恐怕一定治不好了。虽然打败了陈显达，但天下还没有平定，太子年幼弱小，国家的安危全靠你了。过去霍子孟（霍光）、诸葛孔明（诸葛亮）以异姓的身份接受先帝托孤，何况你是我的亲弟弟，又贤明能干，怎能不努力承担这份重任！”元勰流泪说：“平民百姓，尚且能为知己献出生命；何况我依托先帝的神灵，蒙受陛下的恩宠！但我作为陛下的至亲，长期参与朝廷机密事务，得到的宠信和荣耀显赫，天下没有人能比得上；我之所以敢接受重任而不推辞，正是依仗陛下像日月一样光明，能宽恕我不知退让的过错。现在又任命我为首席大臣，总掌朝政大权；这样会让我因‘功高震主’而招致灾祸，这是必然的。过去周公是圣人，周成王也是英明的君主，周公尚且难免被怀疑，何况我呢！如果这样安排，陛下对我的爱护，就不能算是有始有终了。”孝文帝沉默了很久，说：“仔细想想你的话，确实有道理，我无法反驳。”于是亲手写下诏书给太子：“你的叔父元勰，品行高洁，如同白云一样纯净；他厌恶荣华富贵，把松竹的坚贞作为人生追求。我从小就与他亲密相处，不忍心与他分离。我去世后，准许元勰辞去官职，放弃爵位，满足他淡泊退让的本性。”孝文帝又任命侍中、护军将军北海王元详为司空，镇南将军王肃为尚书令，镇南大将军广阳王元嘉为左仆射，尚书宋弁为吏部尚书，让他们与侍中、太尉元禧，尚书右仆射元澄等六人共同辅佐朝政。
夏季，四月初一（丙午日），北魏孝文帝在谷塘原去世。孝文帝对各位弟弟十分友爱，始终没有隔阂。他曾从容地对咸阳王元禧等人说：“我死后，如果子孙后代偶遇不成器的君主，你们可以观察情况，能辅佐就辅佐，不能辅佐就取而代之，不要让江山被外人夺走。”孝文帝亲近任用贤能之人，听从正确意见如同水流向低处一样自然，处理政务精细勤勉，从早到晚不知疲倦。他常说：“君主最担心的是不能做到内心公平、对事物秉持诚意。若能做到这两点，即便是像胡、越那样疏远的人，也能变得像兄弟一样亲近。”他执法虽严厉，对大臣的过错绝不宽容，但对人犯下的小过失，往往会宽恕。曾在饭中发现虫子，又有侍从进献肉汤时不小心烫伤他的手，他都笑着赦免了相关的人。祭祀天地五郊、宗庙二分（春祭、秋祭），他从未不亲自到场主持礼仪。每次外出巡游或领兵出征，官员上奏请求修整道路，他总说：“粗略修补桥梁，能通车马就行，不用铲除草皮把路面修得太平整。”在淮南领兵时，如同在本国境内一样，严禁士兵踩踏损坏粟稻；有时砍伐百姓的树木供给军用，都会留下绢帛作为赔偿。宫室不到万不得已不修建，衣服穿破了，洗干净再继续穿，马鞍、马勒只用铁木制作而已。孝文帝年幼时力气大且擅长射箭，能用手指弹碎羊骨，射猎禽兽没有射不中的；到十五岁时，就不再打猎了。他常对史官说：“时事不能不如实记载。君主掌握赏罚大权，没人能制约他；如果史书再不记录他的恶行，那君主还有什么可畏惧忌惮的呢！”
彭城王元勰与任城王元澄商议，因陈显达撤退还没走远，担心他回头突袭，于是决定隐瞒孝文帝去世的消息，把孝文帝的遗体移到可躺卧的车舆中，只有他们二人和身边几个侍从知道实情。元勰出入时神色和往常一样，侍奉饮食、进献药物、处理外面的奏章，都和平日没有区别。几天后，队伍抵达宛城，夜里把卧舆抬到郡府厅堂，趁机为孝文帝收殓入棺，再把棺木放回卧舆内，外面没人知晓这件事。元勰派遣中书舍人张儒奉诏书征召太子；又秘密把孝文帝去世的消息告知留守洛阳的于烈。于烈安排留守与随行人员的事务，举止毫无异常。太子抵达鲁阳，遇到载有孝文帝棺木的车舆，才正式发布丧事消息；四月十二（丁巳日），太子即位，宣布大赦天下。
彭城王元勰跪着向新帝（北魏世宗）呈交孝文帝的几份遗诏。东宫的官员大多怀疑元勰有谋反之心，暗中防备他，而元勰秉持诚意、恪守礼仪，最终没有让对方找到可乘之机。咸阳王元禧抵达鲁阳，先留在城外观察局势变化，过了很久才进城，对元勰说：“你这次处理丧事，不仅辛苦，实在也很危险。”元勰说：“兄长年纪大、见识深，所以知道其中有危险；我当时像手握毒蛇、骑着猛虎一样（身处险境却无暇顾及），没觉得艰难。”元禧说：“你是埋怨我来得晚了吧。”
元勰等人依据孝文帝的遗诏，下令赐冯皇后自尽。北海王元详派长秋卿白整进宫给冯皇后送毒药，冯皇后边跑边哭喊，不肯喝毒药，说：“皇上怎么会有这样的命令，这是各位亲王要杀我啊！”白整上前按住她，强迫她喝下毒药，冯皇后随即死去。冯皇后的灵柩运到洛阳城南，咸阳王元禧等人确认她确实已死，对视着说：“就算没有先帝遗诏，我们兄弟也该决定除掉她；怎能让品行不端的妇人掌控天下、杀害我们呢！”朝廷给冯皇后定谥号为“幽皇后”。
五月十八（癸亥日），南齐朝廷加封抚军大将军始安王萧遥光为开府仪同三司。
五月二十一日（丙申日，此处日期或为史料记载误差，需结合上下文核对），北魏将孝文帝安葬在长陵，定庙号为“高祖”。
北魏世宗（宣武帝）想任命彭城王元勰为宰相；元勰多次陈述孝文帝的遗旨，请求满足自己淡泊退隐的心愿，世宗对着他悲痛大哭。元勰不断恳切请求，世宗最终任命他为使持节、侍中、都督冀、定等七州诸军事、骠骑大将军、开府仪同三司、定州刺史。元勰仍坚决推辞，世宗不准许，他才前往定州任职。
北魏任城王元澄因王肃是外来归附之人，职位却在自己之上，内心很不服气。恰逢南齐投降北魏的严叔懋告发王肃图谋逃回江南，元澄立即拘禁了王肃，并上奏声称王肃谋反；但经过核查，没有找到谋反的证据。咸阳王元禧等人上奏弹劾元澄擅自拘禁宰相，元澄被免去官职，回到府第居住，不久后被外放为雍州刺史。
六月二十四（戊辰日），北魏追尊世宗的生母高氏为“文昭皇后”，将她的牌位供奉在高祖（孝文帝）的宗庙中配享祭祀，同时扩建高氏的旧墓，命名为“终宁陵”。追赐高氏的父亲高飏勃海公爵位，定谥号为“敬”，让高飏的嫡孙高猛继承爵位；封高氏的哥哥高肇为平原公，弟弟高显为澄城公；三人在同一天接受封爵。世宗一直没见过几位舅舅，这时才赐给他们衣服、头巾并召见，几人都因紧张而不知所措；短短几天内，他们就变得富贵显赫。
秋季，八月初五（戊申日），北魏遵照孝文帝的遗诏，将后宫中三夫人以下的妃嫔全部遣送回家。
南齐的新帝（东昏侯萧宝卷）在做太子时，就不爱学习，只知无节制地嬉戏玩乐；性格迟钝木讷，不爱说话。等到即位后，他不与朝廷大臣交往，只亲信宦官以及身边的御刀、应敕（负责传达旨意的侍从）等侍从人员。
当时，扬州刺史始安王萧遥光、尚书令徐孝嗣、右仆射江祏、右将军萧坦之、侍中江祀、卫尉刘暄轮流在宫内省署值班，按日子签署诏书。雍州刺史萧衍听说后，对堂舅、录事参军范阳人张弘策说：“一个国家有三位掌权的大臣，尚且难以治理，何况现在六位权贵同时在朝，他们必然会互相图谋，祸乱很快就要发生了。要想避祸求福，没有比雍州更合适的地方了，只是我的弟弟们都在京城，恐怕会遭遇灾祸，应当再和益州（萧衍兄长萧懿任职之地）商议对策。”于是萧衍暗中与张弘策整治武器装备，其他人都不能参与谋划。他招募了上万名勇猛的士兵，砍伐了大量木材、竹子，沉入檀溪中，又堆积了像小山一样多的茅草，都没有立即使用。中兵参军东平人吕僧珍察觉了萧衍的意图，也私下准备了几百张船橹。此前，吕僧珍担任羽林监时，徐孝嗣想把他召到自己府中任职，吕僧珍知道徐孝嗣难以长久掌权，坚决请求跟随萧衍。这时，萧衍的哥哥萧懿被免去益州刺史职务返回京城，途中暂时代理郢州事务，萧衍派张弘策劝说萧懿：“现在六位权贵地位相当，每人都能起草诏书，为一点小事争夺权力，按情理必然会互相残杀。皇上从做太子时起就没有好名声，亲近身边小人，性情偏执、残忍暴虐，怎会愿意把朝政交给各位大臣，自己空坐皇位、只在诏书上签字呢！他对大臣的猜忌怨恨积累已久，一定会大肆诛杀朝臣。始安王萧遥光想做像西晋赵王司马伦那样篡权的事，迹象已经显现；但他性格多疑、气量狭小，只会成为祸乱的开端。萧坦之猜忌刻薄、盛气凌人，徐孝嗣容易被人操控，江祏没有决断力，刘暄愚昧软弱；一旦祸乱爆发，朝廷内外都会土崩瓦解，我们兄弟幸好驻守外地藩镇，应当为自身打算；趁现在猜忌防备还没产生，应把弟弟们都召到身边，否则日后恐怕想脱身都没有门路了。郢州控制着荆州、湘州，雍州兵力精锐强盛，天下太平就竭诚效忠朝廷，天下大乱就足以挽救危局；根据时势决定进退，这是万无一失的计策。如果不早点谋划，后悔就来不及了。”张弘策又亲自劝说萧懿：“凭你们兄弟的英武，天下无人能敌，占据郢州、雍州，为百姓请命，废黜昏君、拥立明君，容易得像翻手掌一样，这是春秋时齐桓公、晋文公那样的大业啊。不要被昏庸的君主欺骗，让自己死后被人耻笑。雍州方面已经考虑得很周全了，希望你好好谋划！”萧懿没有听从。萧衍于是把弟弟骠骑外兵参军萧伟、西中郎外兵参军萧憺接到襄阳。
起初，南齐高宗（明帝萧鸾）虽然临终前托付多位大臣辅政，但把很多心腹重任交给了江祏兄弟。江祏、江祀轮流在殿内值班，皇帝的一举一动都要经过他们同意。新帝逐渐想按自己的心意行事，徐孝嗣无法阻止，萧坦之有时会提出不同意见，而江祏却坚决压制，新帝对此深感愤怒。新帝身边的会稽人茹法珍、吴兴人梅虫儿等人，深受新帝信任，江祏却常对他们的行为加以限制，茹法珍等人对江祏恨得咬牙切齿。徐孝嗣对江祏说：“皇上对有些事已有不同意见，怎能总是和他对抗呢！”江祏说：“只要把朝政交给我，一定不会有什么可担忧的。”
皇帝（萧宝卷）的失德行为日渐明显，江祏商议废黜皇帝，拥立江夏王萧宝玄。刘暄曾担任萧宝玄的郢州行事，处理事务过于苛刻。有人向萧宝玄献马，萧宝玄想观赏，刘暄说：“马有什么可看的！”萧宝玄的妃子想要煮鸭肫，手下人向刘暄请示，刘暄说：“早上已经煮了鹅，没必要再煮这个。”萧宝玄怨恨地说：“舅舅太没有外甥舅之间的情分了。”刘暄因此忌恨萧宝玄，不赞同江祏的提议，反而想拥立建安王萧宝寅。江祏与始安王萧遥光秘密谋划，萧遥光自认为年纪更大，想要自己称帝，就用含蓄的话打动江祏。江祏的弟弟江祀也认为年幼的君主难以保住皇位，劝江祏拥立萧遥光。江祏心意动摇，就去询问萧坦之。当时萧坦之正在为母亲守丧，被起用为领军将军，他对江祏说：“明帝（萧鸾）即位，已经不是按照正常顺序，天下人到现在还不服气。如果再做废立君主的事，恐怕天下会分崩离析，我不敢参与这件事。”说完就回到家中继续守丧。
江祏、江祀暗中对吏部郎谢杋说：“江夏王年纪小，要是不能承担治国重任，难道还要再废立一次吗？始安王年纪大，继位不会违背众人的期望。我们不是要靠这个谋求富贵，只是为了让国家安定。”萧遥光又派亲信丹阳丞南阳人刘祏暗中向谢杋表达心意，想拉他入伙，谢杋没有回应。不久，萧遥光让谢杋兼任卫尉事务，谢杋害怕了，就把江祏的谋划告诉了太子右卫率左兴盛，左兴盛不敢揭发。谢杋又劝说刘暄：“一旦始安王登基，刘沨、刘晏就会占据你现在的位置，只会把你当成反复无常的人。”刘晏是萧遥光的城局参军。刘暄假装惊讶，骑马快去告诉萧遥光和江祏。萧遥光想把谢杋外调为东阳郡太守，谢杋平时就轻视江祏，江祏便提议除掉他。萧遥光于是逮捕谢杋，交给廷尉，与徐孝嗣、江祏、刘暄等人联名上奏，称“谢杋煽动朝廷内外，肆意贬低皇帝，私下议论宫廷事务，诽谤皇亲贤臣，轻率评论朝廷大臣”。谢杋最终死在狱中。
刘暄认为如果萧遥光即位，自己就会失去“皇舅”的尊贵地位，不肯赞同江祏的计划；所以江祏迟疑了很久，没能下定决心。萧遥光非常愤怒，派手下黄昙庆在青溪桥刺杀刘暄。黄昙庆看到刘暄的随从很多，没敢动手；刘暄察觉后，就揭发了江祏的谋划，皇帝下令逮捕江祏兄弟。当时江祀正在内殿值班，怀疑情况有异常，派人送信给江祏说：“刘暄好像有别的图谋。现在该怎么办？”江祏说：“应当用冷静来稳住局面。”不久，有诏书召江祏入宫见驾，江祏被留在中书省。起初，袁文旷因斩杀王敬则的功劳应当受封，江祏坚持不批准；皇帝派袁文旷去抓江祏，袁文旷用刀环猛击江祏的胸口，说：“还能阻止我受封吗！”江祏和弟弟江祀都被杀死。刘暄听说江祏等人死了，睡觉时突然惊醒，跑到屋外，问手下人：“抓我的人来了吗？”过了很久，情绪才稳定下来，回到屋内坐下，悲痛地说：“我不是为江祏难过，是为自己今后的处境痛心啊！”
从此，皇帝不再有任何顾忌，更加放纵自己，日夜和亲信在后堂击鼓呼叫、骑马嬉戏。他常常凌晨五更才睡觉，到下午申时才起床。大臣们在节日、初一朝见，要等到下午申时以后才能进见，有时甚至到了傍晚才被打发走。尚书省的奏章，往往要过几十天才能批复，有的甚至不知去向；宦官们把奏章裹着鱼肉带回家，这些都是尚书省等“五省”的重要文书。皇帝经常练习骑马取乐，回头对身边人说：“江祏以前总禁止我骑马；那小子要是还在，我怎么能这样痛快！”接着问：“江祏的亲戚还有谁在？”手下人回答：“江祥现在在冶炼作坊。”皇帝在马上写下敕令，赐江祥死。
始安王萧遥光一向有谋反的野心，和弟弟荆州刺史萧遥欣秘密谋划起兵占据东府，让萧遥欣从江陵领兵火速东下，约定好日期就要行动，可萧遥欣却病死了。江祏被诛杀后，皇帝召萧遥光入宫，把江祏的罪状告诉他，萧遥光很害怕，回到官署后，就假装发疯大哭，接着声称生病，不再进入朝廷办公。
此前，萧遥光的弟弟豫州刺史萧遥昌去世，他的部众都归了萧遥光。等到萧遥欣的灵柩运回，停在东府前的江边渡口，荆州来送灵的士兵人数很多。皇帝诛杀江祏、江祀兄弟后，担心萧遥光不安分，想把他调任司徒，让他回到府第居住，于是召他入宫传达旨意。萧遥光害怕被杀死，乙卯日下午申时，在东府东门召集豫州、荆州的部众，召来刘沨、刘晏等人谋划起兵，以讨伐刘暄为名义。
当天夜里，萧遥光派几百人攻破东冶（冶炼作坊兼监狱），放出囚犯，又从尚方（掌管兵器制造的机构）取出兵器。他还召骁骑将军垣历生，垣历生跟着送信的人来了。萧坦之的宅第在东府城东边，萧遥光派人突袭抓捕他，萧坦之光着上身翻墙逃往朝廷禁宫。路上遇到巡逻主管颜端，颜端把他抓住，萧坦之告诉颜端萧遥光谋反，颜端不信；亲自去探问，确认实情后，才把马给了萧坦之，跟着他一起进入禁宫。萧遥光又突袭尚书左仆射沈文季的宅第，想让他担任都督，恰逢沈文季已经进入禁宫。垣历生劝萧遥光率领东府内的士兵连夜攻打禁宫，用车子装着芦苇焚烧城门，说：“您只需坐车跟在后面，攻下禁宫易如反掌！”萧遥光犹豫不决，不敢出兵。天渐渐亮了，萧遥光穿着军装来到厅堂，命令士兵们登城防守，并进行赏赐。垣历生再次劝他出兵，萧遥光还是不肯，希望禁宫内部自己发生变故。等到太阳升起，朝廷的军队逐渐赶到。禁宫的人刚开始听说叛乱，人心惶惶；到了拂晓，有诏书召徐孝嗣入宫，徐孝嗣来了之后，人心才安定下来。左将军沈约听说变故，骑马奔入西掖门。有人劝他穿上军装，沈约说：“禁宫正混乱，看到我穿军装，有人可能会认为我和萧遥光是一伙的。”于是穿着红色官服入宫。
丙辰日，皇帝下诏特赦建康城（南齐都城）的囚犯，朝廷内外实行戒严。徐孝嗣以下的官员驻守宫城，萧坦之率领禁宫军队讨伐萧遥光。徐孝嗣内心疑虑恐惧，和沈文季穿着军装一起坐在南掖门上，想和沈文季谈论时事，沈文季总是用其他话题岔开，最终没能谈成。萧坦之驻守湘宫寺，左兴盛驻守东篱门，镇军司马曹虎驻守青溪大桥。各路军队从三面包围东府城，焚烧司徒府。萧遥光派垣历生从西门出战，朝廷军队多次战败，军主桑天爱被杀。萧遥光起兵时，询问咨议参军萧畅的意见，萧畅态度严肃，不肯顺从。戊午日，萧畅和抚军长史沈昭略暗中从南门逃出，到禁宫自首，东府的人心因此大受动摇。萧畅是萧衍的弟弟；沈昭略是沈文季哥哥的儿子。
己未日，垣历生从南门出战，趁机扔下长矛向曹虎投降，曹虎下令把他斩首。萧遥光非常愤怒，在床上跳起来，派人杀死垣历生的儿子。当天晚上，朝廷军队用火箭焚烧东府城的东北角楼。到了夜里，东府城被攻破，萧遥光回到小书房的帐中，戴着头巾坐着，拿着蜡烛照着自己，让人抵抗朝廷军队，书房和楼阁的门都层层上锁，手下人却都翻墙逃跑了。朝廷军主刘国宝等人先冲进来，萧遥光听到外面有士兵的声音，吹灭蜡烛，趴在床底下。士兵们撞开房门进来，在黑暗中把他拉出来，斩首示众。朝廷军队入城后，几乎把东府城的房屋烧光。刘沨逃回家里，被人杀死。荆州将领潘绍听说萧遥光叛乱，谋划响应他。西部郎司马夏侯详叫来潘绍商议事情，趁机把他斩首，荆州的官署和百姓才得以安定。
己巳日，朝廷任命徐孝嗣为司空；加封沈文季为镇军将军，侍中、仆射的职位不变；任命萧坦之为尚书右仆射、丹阳尹，右将军的职位不变；任命刘暄为领军将军；任命曹虎为散骑常侍、右卫将军。这些都是奖赏他们平定萧遥光叛乱的功劳。
北魏南徐州刺史沈陵前来投降南齐。沈陵是沈文季的同族侄子。当时北魏徐州刺史京兆王元愉年纪尚小，军府的事务都由兼长史卢渊决定。卢渊知道沈陵将要叛乱，下令各城暗中做好防备；多次把情况上报北魏朝廷，北魏朝廷却不听。沈陵于是杀死手下的将领和僚属，率领宿预（地名）的部众前来投奔南齐，淮河沿岸的各戍守据点因为有防备，得以保全。沈陵在边境多年，暗中结交边境各州的豪杰。他叛乱后，郡县抓捕了很多他的同党并押送过来，卢渊都安抚并赦免了这些人，只把罪责归于沈陵，人心才安定下来。闰月丙子日，南齐立东陵公萧宝览为始安王，作为靖王（萧凤，萧遥光之父）的后嗣。
朝廷任命沈陵为北徐州刺史。
江祏等人失败后，皇帝身边负责持刀护卫、传达旨意的侍从（“捉刀”“应敕”）都肆意专权，当时人称之为“刀敕”。萧坦之性格刚愎、独断专行，受皇帝宠信的侍从们既怕他又恨他；萧遥光死后二十多天，皇帝派延明主帅黄齐济领兵包围萧坦之的宅第，将他杀死，连他的儿子秘书郎萧赏也一同遇害。萧坦之的堂兄萧翼宗任海陵太守，还没赴任，萧坦之对黄齐济说：“堂兄在海陵的家应该没什么问题。”黄齐济问：“海陵的宅子在哪里？”萧坦之告诉了他。黄齐济向皇帝报告，皇帝便派人去抓捕萧翼宗。查抄萧翼宗家时，发现他家非常贫穷，只有几百张借钱的契约，黄齐济把情况报告给皇帝，皇帝赦免了萧翼宗的死罪，将他关押在尚方（掌管兵器制造的机构）。
茹法珍等人诬陷刘暄有谋反之心，皇帝说：“刘暄是我的舅舅，怎么会有这种事？”直阁（宫廷侍卫官）新蔡人徐世标说：“明帝（萧鸾）是武帝（萧赜）的堂兄弟，武帝对他恩宠深厚，他尚且灭了武帝的后代；舅舅又有什么可信任的呢！”皇帝于是杀死了刘暄。
曹虎擅长招纳人才，每天招待的宾客常常有几百人。但他晚年变得吝啬，卸任雍州刺史时，有五千万钱，其他财物也与此相当。皇帝怀疑曹虎是前朝旧将，又贪图他的财产，于是杀死了他。萧坦之、刘暄、曹虎最近刚被任命的官职，都没来得及正式就任就死了。
起初，高宗（萧鸾）临终时，拿自己从偏远之地（西昌）崛起夺权的事告诫皇帝：“做事不能落在别人后面。”所以皇帝多次和亲信谋划诛杀大臣，每次都很仓促，且下定决心后绝不犹豫。从此，大臣们人人都无法保全自己。
九月初四（丁未日），朝廷任命豫州刺史裴叔业为南兖州刺史，征虏长史张冲为豫州刺史。
九月十九（壬戌日），因频繁诛杀大臣，朝廷宣布大赦天下。
九月十三（丙戌日，日期需结合上下文核对），北魏宣武帝拜谒长陵（孝文帝陵墓），想让未做官的亲信吴人茹皓和自己同乘一辆车。茹皓整理衣服准备上车，给事黄门侍郎元匡上前劝谏，宣武帝推开元匡让他退下，茹皓吓得脸色大变，不敢上车。元匡是元新城的儿子。
益州刺史刘季连听说皇帝失德，便变得骄横放纵，用刑严酷，蜀地百姓都怨恨他。当月，刘季连派兵袭击中水（地名），没能攻克。于是蜀人赵续伯等人纷纷起兵叛乱，刘季连无法平定。
枝江文忠公徐孝嗣因是文人，不明确表态反对或支持皇帝，所以尽管职位高、名声大，还能长期存活。虎贲中郎将许准向徐孝嗣陈述时局，劝他废黜皇帝、另立新君。徐孝嗣迟疑了很久，认为一定不用动武就能解决问题；计划等皇帝外出游玩时，关闭城门，召集百官商议废帝。他虽有这个想法，却始终没能下定决心。皇帝身边的宠臣也渐渐憎恨他。西丰忠宪侯沈文季借口年老多病，不参与朝廷权力斗争，侍中沈昭略对沈文季说：“叔父您已经六十岁了，还担任员外仆射（有职无权的闲职），想靠这种方式脱身，怎么可能呢！”沈文季笑了笑，没有回应。冬季，十月二十三日（乙未日），皇帝召徐孝嗣、沈文季、沈昭略进入华林省（宫中机构）。沈文季上车时，回头说：“这次去恐怕是有去无回了。”皇帝派外监（宫廷外的监察官）茹法珍赐给他们毒酒，沈昭略愤怒地骂徐孝嗣：“废黜昏君、拥立明君，是古今不变的准则；你作为宰相却没有才能，才导致今天的下场！”用酒瓯砸徐孝嗣的脸，说：“让你做个破脸鬼！”徐孝嗣喝了一斗多毒酒才死去。徐孝嗣的儿子徐演娶了武康公主，徐况娶了山阴公主，都受牵连被诛杀。沈昭略的弟弟沈昭光听说抓捕的人来了，家人劝他逃跑。沈昭光不忍心丢下母亲，进屋握着母亲的手悲痛哭泣，抓捕的人将他杀死。沈昭光哥哥的儿子沈昙亮逃走后，本已幸免，听说沈昭光死了，叹息说：“家族被灭门，我活着还有什么用！”于是上吊自杀。
起初，太尉陈显达因自己是高帝（萧道成）、武帝（萧赜）时期的旧将，在高宗（萧鸾）在位时，内心一直担忧恐惧，刻意低调，常常乘坐破旧的车子，出行的仪仗也只用十几个瘦弱的士兵。他曾陪高宗宴饮，酒喝到尽兴时，向高宗借枕头，高宗让人给他拿来。陈显达抚摸着枕头说：“我年纪大了，富贵也足够了，只缺一个枕头来枕着死去，特意向陛下乞求这个（暗示想退休保命）。”高宗脸色大变，说：“您喝醉了！”陈显达以年老为由请求退休，高宗不同意。后来王敬则谋反，当时陈显达正领兵抵抗北魏，始安王萧遥光怀疑他，上奏高宗想召回他的军队；恰逢王敬则叛乱被平定，才作罢。等到皇帝（萧宝卷）即位，陈显达更不愿意留在建康，后来得到江州刺史的职位，非常高兴。他曾生病，不让医治，不久病自愈了，反而很不高兴（觉得没能借此退休）。听说皇帝多次诛杀大臣，又有传言说皇帝要派兵袭击江州，十一月十五日（丙辰日），陈显达在寻阳起兵，命令长史庾弘远等人给朝廷权贵写信，列举皇帝的罪状，信中说“想拥立建安王（萧宝寅）为君主，等京城的战乱平息后，就向西迎接建安王登基”。
十一月二十四（乙丑日），朝廷任命护军将军崔慧景为平南将军，统领各路军队攻打陈显达；后军将军胡松、骁骑将军李叔献率领水军占据梁山（地名）；左卫将军左兴盛统领前锋军队驻守杜姥宅（地名）。
十二月十二（癸未日），朝廷任命前辅国将军杨集始为秦州刺史。
陈显达从寻阳出发，在采石打败胡松，建康全城震惊恐慌。十二月十三（甲申日），陈显达的军队驻扎在新林（地名），左兴盛率领各路军队抵抗。陈显达在岸边设置很多营火迷惑敌军，暗中派军队连夜渡江，袭击宫城。十二月十四（乙酉日），陈显达率领几千人登上落星冈（地名），新亭的各路军队听说后，纷纷逃回宫城，宫城陷入极大恐慌，士兵们关闭城门防守。陈显达手持马槊，带着几百名步兵，在西州前与朝廷军队交战，两次交锋后，陈显达大胜，亲手杀死几人，马槊都折断了；朝廷军队陆续赶到，陈显达无法抵抗，撤退到西州后面，骑官赵潭用长矛刺中陈显达，陈显达坠马，被斩首，他的几个儿子也都被处死。长史庾弘远是庾炳之的儿子，在朱雀航（桥梁名）被斩首。临刑前，庾弘远索要帽子戴上，说：“子路临死时系好帽缨，我不能不戴帽子死去。”他对围观的人说：“我不是反贼，而是义兵，是为各路军队请命啊。陈公（陈显达）做事太轻率；如果他听我的话，天下就不会遭受战乱之苦了。”庾弘远的儿子庾子曜抱着父亲，请求代替父亲去死，也被杀死。
皇帝诛杀陈显达后，更加骄横放纵，渐渐频繁外出游玩，又不想让人看见自己；每次外出，都先驱赶所经之处的百姓，只留下空房子。负责警卫的尉司敲鼓清道，鼓声所到之处，百姓必须立刻逃跑，连穿衣穿鞋的时间都没有，违反禁令的人会被当场杀死。皇帝一个月外出二十多次，每次出去都不说明去向，东西南北，没有不去的地方。他常常在凌晨三四点出发，鼓声四处响起，火光冲天，旗帜兵器横在路上。百姓们喧哗奔逃，老人小孩都被吓得惊慌失措，哭喊声塞满道路，到处都被封锁，没人知道皇帝要经过哪里。士农工商都无法正常谋生，打柴的路被阻断，婚丧嫁娶都错过时机，产妇只能在外面临时分娩，有的人生了病被扔在路边，尸体无法安葬。街巷里悬挂帐幔作为高大的屏障，安排伏兵防守，称之为“屏除”，也叫“长围”。皇帝曾到沈公城，有一个妇人正临产，没能逃走，皇帝就下令剖开她的肚子，查看胎儿的性别。他还曾到定林寺，有一个老和尚因生病无法逃走，藏在草丛里；皇帝命令手下人射箭，上百支箭同时射向老和尚。皇帝力气很大，能拉开三斛五斗的弓。他还喜欢玩“担幢”（杂技，用头顶或牙齿顶长杆），白虎幢高七丈五尺，他用牙齿顶着，即使牙齿折断也不觉得累。他还亲自制作担幢的器具，表演时穿的杂技服装用金玉装饰，侍卫们围在旁边，他尽情展示各种技巧，毫无羞愧之色。皇帝向东冶的士兵俞灵韵学习骑马，常常穿着织成的短袄和裤子，戴着镶金的薄帽，手持装饰着七种宝石的长矛，穿着紧身衣，冒着雨雪骑马，不躲避坑洼。他骑马驰骋到口渴时，就下马，解下腰边的瓢形器具，舀水喝，然后再上马继续奔驰。他还挑选擅长奔跑的无赖小人，组成五百人的“逐马左右”，经常让他们跟在自己身边。有时他会在集市旁经过亲信的家，绕来绕去，走遍全城。有时他会出城射野鸡，设置了二百九十六处射雉场，四处奔走，几乎没有休息的时间。
王肃为北魏制定官阶和官府机构设置，都仿照江南（南齐）的制度，共分九品，每品又分正、从两级。侍中郭祚兼任吏部尚书。郭祚清廉谨慎，重视官位的授予，每次选拔官员，即使找到了合适的人选，也一定会犹豫很久才下笔，说：“这个人就要显贵了。”人们因此大多怨恨他；但他选拔的官员没有不称职的。