13世纪中叶，西藏正式归入中国元朝版图。元朝皇帝设置了宣政院，直接管理西藏地区军政要务。这一机构的人员选用由皇帝决定，它的报告直接送给皇帝。掌握宣政院实权的是“院使”，一般由中央政府总理全国政务的右丞相兼领。
1368年明王朝接替元王朝，继承了治理西藏的权力。明朝中央对元代的官职名称、品秩，大都保留原状。在今西藏中部和东部分别设立“乌思藏行都指挥使司”与“朵甘行都指挥使司”，隶属于陕西行都指挥使司，相当于行省级军区机构，兼理民政。西藏西部阿里另设置“俄力思军民元帅府”。这些机构的负责官员均由中央任命。
达赖喇嘛和班禅喇嘛两大活佛系统属于藏传佛教格鲁派。格鲁派在明代兴起，三世达赖喇嘛本是格鲁派的一个寺院的住持。明朝中央特别开例，准予他入贡，1587年封赐他以“朵儿只唱”名号。
洪承畴得到李勇的授意，将以大明的名义分别册封四世达赖喇嘛和四世班禅喇嘛。反正李勇冒用崇祯的萝卜章不知道多少次，再多一次也无所谓，崇祯不出北京，什么都不知道，知道了，又能咋地！
接受这次的册封，自此将正式确定了达赖喇嘛和班禅额尔德尼的封号，以及他们在西藏的宗教地位——李勇很鸡贼，这次只给宗教地位，可没给政治地位。达赖喇嘛在拉萨统治西藏的大部分地区，班禅额尔德尼在日喀则统治西藏的另一部分地区。
使者们反复向达赖喇嘛和班禅喇嘛详细说明了册封的意义和好处。他们表示，大明将尊重黄教的传统和信仰，支持达赖喇嘛和班禅喇嘛在西藏的宗教领导地位。抠门的大明丝毫不提黄教可以管理西藏的政务。
达赖喇嘛和班禅喇嘛虽有不爽，但经过深思熟虑，最终接受了大明的册封。他们也清楚，这是黄教在蒙藏地区大发展的一次重要机遇，也是与明国中央建立紧密联系的重要契机。
随着达赖喇嘛和班禅喇嘛接受册封，有中央政府背书的黄教，在西藏的影响力将更迅猛扩大。而李勇的奸计也将得逞，客观上让众多喇嘛和信徒们，接受了大明的统治，共同维护西藏的和平与稳定，妥妥一次双赢，但对藏巴汗来讲，却是输两次。
崇祯六年八月，再次有了带路党的三万明军铁骑如乌云般压向拉萨。洪承畴站在军阵前，神色冷峻，宛如一尊杀神。他目标明确，此次入藏，不仅要摧毁盘踞于此的藏巴汗政权，更要从根本上重塑西藏的行政与宗教格局。
“传令下去，围城一日，务必攻陷！”洪承畴大手一挥，下达了进攻的命令。三万大军如潮水般涌向拉萨城，喊杀声震天动地。
藏巴汗站在拉萨城墙上，望着城外密密麻麻的明军，心中充满了恐惧。他用脚指头都想明白了，自己根本无力抵挡这来势汹汹的进攻。“这可如何是好？”他焦急地来回踱步，试图寻找一线生机。
仅仅一天时间，拉萨城便被攻陷。城门在明军的猛烈攻击下轰然倒塌，明军如潮水般涌入城中。藏巴汗在乱军中被杀死，结束了他对拉萨的统治。
洪承畴踏入拉萨城，看着满目疮痍的街道和惊恐万分的百姓，其实更多的都是衣不遮体的农奴。他这时开始理解李勇的想法，要真正掌控西藏，仅靠武力是不够的，还需要一系列的制度变革。
“传我命令，着手改订西藏的行政体制！”洪承畴下令道，“特别是发起废奴运动，赢取民心！”
他不出三日就发现，西藏的农奴制是阻碍社会进步的毒瘤，只有废除农奴制，解放农奴，才能赢得“民心”。同时，他立即设立驻藏大臣，自己先临时顶上，开始代表中央对西藏地方施政，确保西藏与中央形成直属关系。
“转世灵童的剃发、取法名、选定授戒的师傅和授经的师傅，也都须经过驻藏大臣奏报朝廷核准。”洪承畴继续说道，“当举行达赖喇嘛、班禅额尔德尼的坐床和亲政典礼时，中央派大员亲临监视。”
西藏各大活佛包括达赖喇嘛、班禅额尔德尼去世后转世灵童的大权，从此由大明中央政府掌握。每逢一代达赖喇嘛、班禅额尔德尼和西藏各大转世活佛的转世灵童觅到时，即将灵童姓名缮写在签上，纳入中央颁发的金瓶，由驻藏大臣会集有关大活佛，掣签确定。
洪承畴进一步搞明白藏传佛教后，不由得更深深的佩服李勇，这个“老大”是怎么知道？这一制度将有效防止西藏活佛转世被地方势力操纵，确保中央对西藏宗教事务的掌控。还搞个金瓶和签现保存在拉萨，让它成为中央权威的象征。
洪承畴——这个以镇压农民军起家的官僚，快速建立一系列措施，开始确保了西藏宗教事务的规范化和中央化，让西藏的宗教领袖反而真正成为中央的代表。洪承畴这个手上沾满农民军鲜血的老狐狸深知，要稳定西藏的局势，必须有一套强硬的手段。他向李标正式建议，必须要有一个能杀得人头滚滚的驻藏大臣，杀得越多，杀得越狠，中央的统治就越稳定。
“洪屠夫，不对，洪承畴大人就非常适合当第一任这个大臣！这是少爷亲点的！”李标用调侃的口吻回复道。
洪承畴并未理会这些调侃，功和名可不是白得的。以铁血手段，维护西藏的稳定，确保中央的权威。“我洪承畴一定会让西藏的农奴们知道，大明才是他们真正的依靠！我才是你们的救星”洪承畴心中暗忖，但最后的结果是，非常遗憾！农奴们只认可是李勇将军解放了他们。
很快，洪承畴收到了来自两大活佛的回信，他们全面接受了大明的“安排”。洪承畴心下大定，再无顾忌，此刻他就是西藏的王，他立即祭出比对农民军更狠十倍的“十杀令”！下令大军继续四处扫荡，巩固自己在西藏的统治。
随着拉萨的攻陷和藏巴汗的死亡，西藏驻军也打通了藏南通道，居然与贾罕吉尔纳加尔（达卡）南方战区赵石取得了联系。至此，整个雪域高原被全部实控，大明的西南边境终于定型，至于莫卧尔那个粪坑国家，李勇是现在一点兴趣没有，未来也没有！如果有的话，那只是赚他们手中的金银，低价收购他们廉价的物产。
洪承畴站在拉萨的布达拉宫前，望着远方连绵的雪山，心中满是欢喜。自己已经立下不世之功——这次成功册封，表面上是确立了达赖喇嘛和班禅喇嘛在西藏的政治和宗教地位，实际上是让黄教势力彻底归心。摧毁了藏巴汗政权，更重塑了西藏的行政与宗教格局，现在农奴翻身解放，土地国有，奴隶主被清算，西藏真正成为大明不可分割的一部分。“雪域高原皆为大明之疆土！自己青史留名——稳了！”洪承畴喃喃自语，嘿嘿的阴笑，眼中闪烁着凶狠的光芒——背后是滚滚的人头落地。
当洪承畴的南路大军向西宁出发时，强大的西部战区八万的主力打击群——六个师（203师贺虎臣、204骑兵师张新亮、206骑兵师王铁柱、207骑兵师高迎祥、208骑兵师刘国能、209骑兵师曹文诏）和两万漠南蒙古仆从军，在李标亲自率领下开始漫长而艰苦的行军。