“英灵殿”坠毁的消息传遍全球，“盘古”的残余势力陷入群龙无首的混乱，国际刑警趁机展开大规模抓捕。陆沉团队回到总部后，本以为可以迎来短暂的安宁，却在一周后收到了敦煌研究院的紧急求助——莫高窟的壁画上突然出现了奇怪的符号，与“盘古”的图腾高度相似，而且参观的游客中接连出现意识混乱的症状。
乘坐专机抵达敦煌时，夕阳正将莫高窟染成金红色。研究院院长李教授带着众人来到第320窟，壁画上的飞天图案旁，多出了一串扭曲的符号，在灯光下泛着微弱的蓝光。“这些符号是三天前突然出现的，”李教授的脸色凝重，“一开始以为是人为涂鸦，但用溶剂根本擦不掉，而且靠近的人都会出现幻觉。”苏晴用探测器扫描后，脸色一变：“是量子纠缠符号，能干扰人类的意识波，和‘英灵殿’的技术同源！”
当晚，陆沉团队在窟内设置了监测设备。凌晨三点，符号突然发出强烈的蓝光，壁画上的飞天图案竟然开始移动，化作无数个小人，在墙壁上奔跑。“是全息投影技术，”苏晴快速记录数据，“符号是信号接收器，有人在远程传输影像干扰意识。”陈默通过热成像仪观察，发现莫高窟后山的悬崖上有个信号发射点：“在那里！”
后山的悬崖陡峭如刀削，陆沉和陈默借助攀岩绳向上攀登。发射点隐藏在一个天然的洞穴中，里面有一台精密的信号发射器，屏幕上显示着传输进度：“70%”。“还有三分钟就传输完成了！”陈默刚要摧毁发射器，就见一个穿灰色风衣的人从洞穴深处走出，手中拿着一把沙漠之鹰：“陆沉，别来无恙。”
“是你，‘元初’！”陆沉瞳孔骤缩，这个人是“盘古”的创始人之一，传说中已经死在十年前的围剿中。“元初”冷笑一声，按下了手中的遥控器，洞穴突然开始震动：“这些符号不仅能干扰意识，还能激活莫高窟地下的‘龙脉能量’，为‘盘古’的‘重生计划’提供动力。”他将一个青铜匣子扔在地上，“里面是‘龙脉钥匙’，没有它，你们永远找不到地下基地。”
“重生计划是什么？”陆沉举枪对准他。“元初”转身跳入洞穴后的暗门：“等你们找到地下基地就知道了。”陈默想要追赶，却被陆沉拦住：“先摧毁发射器，再追他！”当发射器被炸毁时，莫高窟内的符号停止了发光，壁画也恢复了正常。李教授的声音从通讯器传来：“游客的幻觉消失了！”
回到研究院，众人打开了青铜匣子，里面是一块刻着龙纹的玉佩，玉佩上的纹路与莫高窟的符号一致。“这是‘龙脉钥匙’，”李教授看着玉佩，“莫高窟的地下确实有座唐代的密室，传说里面藏着镇压‘龙脉’的法器，但从来没人找到过入口。”埃琳娜将玉佩放在第320窟的地面上，玉佩突然发出绿光，地面上的石板缓缓移开，露出一个狭窄的通道。
通道内弥漫着千年的尘埃气息，墙壁上的唐代壁画保存完好，画着道士镇压妖魔的场景。走了大约两百米，眼前出现一座石门，门上刻着“非天命者不得入”的字样。苏晴用玉佩扫描后，石门缓缓打开，里面是一座巨大的地下宫殿，中央矗立着一根盘龙柱，柱身上缠绕着无数的青铜锁链。“这不是什么龙脉，”苏晴的探测器发出警报，“是‘盘古’的能量转换装置，用地下的地热能转化为量子能量！”
宫殿的四周摆放着数十个玻璃舱体，里面躺着的人都是最近失踪的考古学家和物理学家。“‘元初’要利用他们的知识，完善‘重生计划’，”陆沉看着舱体上的仪器，“这些人被注入了‘意识催化剂’，很快就会变成‘盘古’的傀儡。”陈默突然发现宫殿的角落里有个监控屏幕，上面显示着“元初”的影像：“陆沉，我在‘重生计划’的核心区域等你，迟到的话，这些人就永远醒不过来了。”
根据监控屏幕的提示，核心区域在宫殿的地下三层。当众人抵达时，眼前的场景让他们震惊——这里是一座巨大的量子对撞机，周围的屏幕上显示着“意识实体化”的实验数据。“元初”站在对撞机前，手中拿着一个水晶容器：“这是‘意识实体化药剂’，能让意识脱离肉体，变成实体存在。”他将药剂注入一个实验体，实验体的身体突然化作光点，然后重新凝聚成一个透明的人形，“这就是‘重生计划’，让‘盘古’的核心成员实现意识永生！”
“你疯了！”陆沉大喊着，“意识实体化需要巨大的能量，会引发地壳运动，整个敦煌都会被摧毁！”“元初”按下了对撞机的启动按钮：“为了‘盘古’的伟大事业，牺牲是值得的！”对撞机发出刺耳的轰鸣声，地面开始剧烈震动，墙壁上的石块不断掉落。
苏晴立刻连接对撞机的控制系统：“我可以修改程序，让能量反向输出，摧毁核心！”陈默和埃琳娜挡住冲过来的守卫，埃琳娜的弩箭精准地射中守卫的膝盖，陈默的狙击枪则击中了他们手中的武器。陆沉冲向“元初”，两人展开了近身搏斗。“元初”的身手十分敏捷，手中的短刀不断刺向陆沉的要害，陆沉凭借着丰富的战斗经验，不断躲避着攻击。
“能量反向输出程序启动！还有三十秒！”苏晴大喊着，“快撤离！”陆沉一拳击中“元初”的腹部，将他按在地上：“你的计划不会得逞的！”“元初”突然拿出一枚手雷，拉开保险栓：“我得不到的，你们也别想得到！”陆沉立刻将他推开，手雷在地上爆炸，烟雾弥漫。
当众人冲出地下宫殿时，身后传来剧烈的爆炸声，通道被彻底坍塌。李教授的声音从通讯器传来：“地热能的异常波动消失了！敦煌安全了！”陆沉看着莫高窟的方向，心中却没有丝毫放松。苏晴走到他身边，递过一块从“元初”身上搜出的碎片：“这是‘盘古’的‘创世图谱’碎片，上面的标记指向西藏的布达拉宫。”
前往西藏的飞机上，陆沉翻看着“创世图谱”的碎片。上面的符号与沈渊的意识网络图谱相似，但更加复杂。“‘元初’只是‘盘古’的中层成员，”埃琳娜看着窗外的雪山，“真正的核心还没有出现。”陈默点头：“布达拉宫是藏传佛教的圣地，‘盘古’选择在那里建立据点，肯定有特殊的目的。”
抵达拉萨后，陆沉团队伪装成朝圣者，进入了布达拉宫。苏晴的探测器在白宫的顶层发出警报：“能量反应就在这里！”顶层的佛堂里，一尊巨大的佛像背后有个暗门，暗门内是一间密室，里面摆放着数十台电脑和通讯设备。“这是‘盘古’的通讯中枢，”苏晴快速破解电脑密码，“他们在联系全球的残余势力，计划在明年的春节期间，发动全球范围的‘意识革命’！”
电脑里的文件显示，“盘古”的最终首领代号“天帝”，真实身份无人知晓，但他的指令能调动所有残余势力。“‘意识革命’就是用‘意识干扰器’，在全球的人口密集区释放干扰波，让所有人的意识陷入混乱，然后‘盘古’的成员趁机控制各国的政权，”苏晴的脸色凝重，“干扰器的核心部件藏在布达拉宫的地宫中。”
地宫的入口隐藏在红宫的一座佛塔下，用“创世图谱”的碎片才能打开。地宫内，巨大的干扰器已经组装完成，周围站着数十个“盘古”的核心成员。“天帝”站在干扰器前，穿着红色的长袍，脸上戴着金色的面具：“陆沉，你终于来了。‘盘古’的创世大业，需要用你的失败来献祭。”
“你的计划不会得逞的！”陆沉举枪对准他。“天帝”冷笑一声，按下了干扰器的启动按钮：“已经晚了，干扰波已经开始扩散！”苏晴立刻连接干扰器的控制系统：“我可以用‘创世图谱’的碎片，让干扰波反向，只影响‘盘古’的成员！”她将碎片插入接口，干扰器发出强烈的蓝光，“反向成功！”
“盘古”的核心成员突然陷入混乱，互相攻击。“天帝”见计划败露，想要逃离，却被埃琳娜的钩锁缠住。陆沉冲过去，摘下了他的面具，露出了一张熟悉的脸——是国际刑警的高层之一，詹姆斯！“没想到吧，”詹姆斯的眼中充满了疯狂，“我才是‘盘古’的真正首领，沈渊只是我的棋子！”
当詹姆斯被戴上手铐时，他看着陆沉：“你以为摧毁了干扰器就赢了吗？‘盘古’的‘种子’已经撒遍全球，只要人类还存在欲望和贪婪，‘盘古’就会一直存在！”陆沉看着他：“只要还有人守护正义，‘盘古’就永远不会成功。”布达拉宫的阳光透过窗户，照在地上的“创世图谱”碎片上，碎片的光芒逐渐消散。