阳光透过树叶洒在通往月见山的小路上，小智、小霞、小刚还有云十三，正快步前行。小刚走在最前，突然停下脚步：“前面就是月见山了，据说那里藏着能让宝可梦进化的神秘石头。”
“神秘石头？”小智好奇地凑上前，皮卡丘从他肩头探出头，耳朵轻轻晃动。云十三则摸了摸大黄的脑袋，大黄对着前方的山林轻吠一声，似乎也察觉到了什么。
话音刚落，前方突然传来呼救声：“救命啊！”四人立刻循声跑去，只见山洞入口处，一群超音蝠正围着一个穿白大褂的男人攻击。
“皮卡丘，用电击！”小智立刻下令。皮卡丘周身泛起电光，黄色电流瞬间击中超音蝠群。
云十三也同时开口：“大黄，用火花辅助！”大黄张开嘴，喷出细小的火焰，火焰与电流交织，超音蝠受惊四散飞逃，其中一只翅膀受伤的超音蝠落在地上，挣扎着想要起飞。
男人松了口气，激动地抱住小智：“太感谢了！你真是我的救命恩人！”皮卡丘见状，对着男人的手臂放出微弱电流，男人吃痛松开手。“哦抱歉，我太激动了。”他推了推眼镜，“我是尼比市博物馆的研究员李科，专门来月见山研究传说中的月亮石。”
“月亮石是什么？”小霞好奇地问。此时，云十三走到受伤的超音蝠旁，大黄温顺地蹲在一旁，没有发起攻击。云十三看着超音蝠眼中的警惕，从背包里拿出伤药，轻轻递到它面前：“别怕，我帮你处理伤口。”超音蝠犹豫片刻，慢慢凑上前，任由云十三为它包扎翅膀。
李科眼中闪着光芒，语气郑重：“传说百万年前，一块陨石落在月见山，那就是月亮石，它能增强宝可梦的力量，甚至触发进化！但最近有人在山洞里装了强光灯，惊扰了洞里的宝可梦，我怀疑他们是为了偷月亮石。”
处理好超音蝠的伤口，云十三拿出精灵球：“你愿意跟我一起旅行吗？我会好好照顾你。”精灵球轻轻碰了碰超音蝠，红光闪过，超音蝠被成功收服。云十三收起精灵球，对着大黄笑道：“以后又多了个伙伴。”大黄欢快地摇了摇尾巴。
四人走进山洞，果然看到墙壁上挂着刺眼的强光灯，几只派拉斯无措地爬着，一只穿山鼠趴在地上喘着粗气。
“这些灯光会吸干洞窟里的湿气，对它们太残忍了。”小刚皱眉道。云十三放出刚收服的超音蝠，轻声说：“这里是你的家园，带我们去看看情况吧。”超音蝠振翅在前，带着众人向山洞深处走去。
这时，一只粉色的小身影从拐角窜过，手里还抱着块黑色石头。“那是什么？”小智掏出宝可梦图鉴，图鉴立刻响起声音：“皮皮，气球宝可梦，据说来自外太空，喜欢在满月的夜晚活动。”
“好可爱！我要收服它！”小智刚要抛出精灵球，被李科拦住：“别碰它！皮皮是月见山的守护者，它们和月亮石有着很深的羁绊。”云十三的超音蝠在一旁轻鸣，似乎在认同李科的话。
话音未落，山洞深处传来皮皮的叫声。四人循声跑去，只见皮皮被困在死胡同里，喵猫正堵在路口，身后还站着 武藏 和 小次郎。“火箭队！”小智咬牙道
“既然被发现了，就别怪我们直说了。”武藏拨了拨头发，火箭队三人组整齐地摆出姿势：“为了防止世界被破坏，为了守护世界的和平，贯彻爱与真实的邪恶，可爱又迷人的反派角色！武藏！，次郎！我们是穿梭在银河的火箭队！白洞，白色的明天在等着我们！就是这样，喵！”
“是你们装的强光灯？”李科愤怒地质问。
小次郎轻笑一声：“没错，我们要找到月亮石，用它强化宝可梦，然后征服世界！”
“我绝对不会让你们得逞！”小智抛出精灵球，“巴大蝶，就决定是你了！”小刚也拿出精灵球：“我的新伙伴也该登场了，超音蝠！”云十三同样放出超音蝠：“一起战斗吧，超音蝠！大黄，你负责警戒！”
“阿柏蛇，上！”“瓦斯弹，出来吧！”武藏和 小次郎 同时放出精灵。
“瓦斯弹，用烟雾！”小次郎下令，黑色烟雾瞬间笼罩战场，小霞连忙捂住鼻子：“可恶，什么都看不见了！”
“巴大蝶，用旋风！两只超音蝠，配合它！”小智喊道。巴大蝶和两只超音蝠同时振翅，强风将烟雾吹向火箭队，武藏 和 小次郎 瞬间被烟雾笼罩。大黄则警惕地盯着烟雾，一旦有异常动静便准备发起攻击
“阿柏蛇，咬碎！”武藏胡乱的指挥着，阿柏蛇朝着前方咬去，却咬中了旁边的瓦斯弹。“瓦斯弹，用撞击！”小次郎喊道，瓦斯弹径直撞向阿柏蛇
“超音蝠，用超音波！”小刚和云十三同时下令。两只超音蝠发出刺耳声波，阿伯蛇和瓦斯蛋瞬间陷入混乱，互相攻击起来。“巴大蝶，旋风收尾！”小智大喊道，强劲的旋风将火箭队和两只混乱的精灵一同卷起，抛出了山洞：“好讨厌的感觉啊！”
“等等，喵猫不见了！”小霞突然发现不对劲，此时，皮皮抱着石头跑出山洞，李科和小霞立刻跟了上去。云十三让大黄留下照看受伤的宝可梦，自己则带着超音蝠跟上。在山间的窄桥上，喵猫突然窜出：“把月亮石交出来，喵！”皮皮吓得跳下桥，正好撞在小霞身上，两人一同摔进桥下的浅滩。
“太过分了！”小霞抛出精灵球，“宝石海星，出来战斗！”“宝石海星，用水枪！”蓝色水柱直击喵猫。云十三的超音蝠也趁机发起攻击，用翅膀拍打水面，溅起的水花加剧了水枪的威力，喵猫惨叫着被冲飞：“可恶，你们给我记住，喵！”
傍晚，四人跟着皮皮来到月见山深处的开阔地。月光洒下，中央矗立着一块巨大的白色岩石——正是月亮石本尊。周围聚集着数十只皮皮，它们捧着小块月亮石，围着巨石跳起了神秘的舞蹈。大黄不知何时也跟了过来，安静地趴在云十三脚边，看着眼前的景象。
“这就是传说中的月亮石……”李科看得热泪盈眶。突然，火箭队的飞行器从天而降，小次郎大笑道：“多谢你们帮我们找到月亮石！”
“不准碰它！”小智大喊着要冲上去，却被小刚拦住“小智，不要冲动”
小次郎探出头，脸上满是得意，“这下，征服世界的计划又近了一步！”
武藏则迅速掏出特制的巨型捕网，按下发射器按钮，一张坚韧的合金网呼啸着落下，精准地将巨大的月亮石牢牢罩住。“到手了!小次郎，快启动挖洞装置！”
小次郎立刻操作飞行器下方的机械臂，只见钻头飞速旋转，“轰隆”一声钻进地面，飞行器拖着被网住的月亮石，顺着刚挖好的隧道飞速下沉，只留下地面上一个黑漆漆的洞口。
“休想带走月亮石！”小刚眼疾手快，迅速抛出精灵球，“大岩蛇，拜托你了！”红光闪过，庞大的大岩蛇盘旋而出，小刚指着洞口下令：“用挖地洞，追上它们！”
大岩蛇发出一声低沉的嘶吼，脑袋猛地扎进地面，身体如游龙般钻入土壤，地面只留下一道快速移动的土痕，紧紧追着火箭队的隧道方向而去。云十三立刻让大黄守住洞口，自己则带着超音蝠飞到空中，观察隧道延伸的轨迹，随时向小刚传递位置信息
隧道外，火箭队正得意洋洋地操控飞行器拖拽月亮石，武藏兴奋地说：“马上就能逃出月见山，没人能追上我们！”话音刚落，飞行器突然剧烈震动，前方的土层轰然破开，大岩蛇的脑袋猛地探了出来，巨大的身躯瞬间堵住了去路
“什么？！”武藏惊得跳了起来，“阿柏蛇，用咬碎！”阿柏蛇朝着大岩蛇的鳞片咬去，却只留下一道白痕。“大岩蛇，用绑紧！”小刚的声音从火箭队三人身后传来，大岩蛇长长的身体瞬间缠住飞行器，飞行器的引擎发出刺耳的故障声
火箭队慌乱间，竟强行启动飞行器最大功率，试图挣脱束缚，结果“咔嚓”一声，合金网被扯得变形，巨大的月亮石从网中滑落，重重砸在地面
“不好，快逃！”小次郎见状，立刻放弃月亮石，操控飞行器转向，想要挖新的隧道逃跑。就在这时，大岩蛇挖出的洞口突然传来密集的“皮皮”声——无数只皮皮顺着大岩蛇挖开的土壤缝隙钻了出来，它们捧着小块月亮石，眼中闪烁着坚定的光芒
为首的皮皮对着同伴们叫了一声，所有皮皮同时举起手中的月亮石，周身泛起柔和的光芒。它们默契地围成一圈，同时发动挥指功，无数道彩色的能量光束从月亮石中迸发，汇聚成一道耀眼的能量洪流，直直轰向火箭队的飞行器
“啊——！”伴随着三人一猫的惨叫，飞行器被能量洪流击中，冒起滚滚黑烟，彻底报废。火箭队浑身焦黑地从残骸里爬出来，还没等站稳，就被大岩蛇用身体一卷，直接扔出，落在了大黄面前
大黄对着三人龇牙低吼，火箭队吓得魂飞魄散，连滚带爬地跑远，只留下一句“好讨厌的感觉啊！”在夜空中回荡
小刚指挥大岩蛇将巨大的月亮石托起来，皮皮们立刻围上去，用小爪子轻轻抚摸着月亮石，发出安心的叫声。李科走上前，看着完好无损的月亮石，感激地对众人说：“多亏了你们，还有大岩蛇和皮皮们，月亮石才没有被抢走。”
云十三笑着摇摇头：“这是我们应该做的，而且，真正守护住它的，是这些热爱月亮石的皮皮啊。”月光下，皮皮们再次围着月亮石跳起舞蹈，大岩蛇温顺地趴在一旁，大黄和超音蝠也静静陪伴
神奇的是，小块月亮石落在皮皮身上，不少皮皮周身泛起进化的光芒，体型变大，长出了粉色的翅膀——进化成了皮可西。云十三的超音蝠也被月光与能量包裹，身体微微变大，气息变得更强
第二天清晨，李科看着眼前的皮皮、皮可西族群，还有云十三那只更加强健的超音蝠，转头对四人说：“我决定留下来，守护它们和月见山。”他递给小智和云十三各一块小月亮石，“这个送给你们，算是感谢。”
小智和云十三接过月亮石，用力点头：“李科先生，我们会来看你的！”四人挥手告别，小刚突然想起什么：“对了，华蓝市的道馆是水系的，小智，你可得好好准备啊！”
“放心吧！”小智举起右手，皮卡丘跳到他肩头。云十三摸了摸大黄和超音蝠，扯了扯手上的黑色半指手套，笑着说：“出发，目标华蓝市！”