为了找到由基拉内心阴影的根本原因，小智他们通过一根黑刺，来到了另一个世界。
“这里又是哪里呢?”小霞看着周围什么都没有的景象，不禁问道。
小智看着怀里的皮卡丘，“我想，这是由基拉还是蛋时的内心世界，应该是他出生前看到的景象。”
皮卡丘和波克比都变回原来的大小，忽然，一个巨大的黑色身影，出现在小智他们面前，这个黑色身影格外狰狞和扭曲，还伴随着机器的轰鸣声。
“小智，那是什么?”
然后，黑色装甲车身影，伸出一对机械手臂，朝着小智他们冲了过去，接着这些机械手臂，长出许多黑色触手，将小智一行人包裹在里面。
“好可怕，好可怕，好可怕....”
小霞听着这个地方，到处都是这个声音：“好害怕的样子。”和莎莉娜同时往小智方向靠了靠。
牢笼的外面，出现三个人类的身影，小智看着眼前的画面微微皱眉：“看样子，就是这三个家伙抓走的由基拉，见面时一定要送他们一拳！”
面前的场景不断在变化，一只班吉拉的身影出现在他们的眼前。
“妈妈…”很显然，那是由基拉的母亲。
作为一个母亲，孩子被盗走，班吉拉的愤怒可想而知，随后又无能的，被人类的炮火所吞噬，只能无力的哀嚎，即使是成年期的准神神奇宝贝，面对人类科技也只有无力。
随后他们看到，在炮火的覆盖下，班吉拉的身体出现一道裂缝。
由基拉不断呼喊着，但班吉拉也只能眼睁睁看着，三个坏人把自己的孩子抢走。
“md，这群人渣，祈祷吧，别让我见到你们。”小智咬着牙愤怒的说。
“简直太可恶了，还对神奇宝贝使用武器。”就连平常喜怒不形于色的小刚，也是一脸愤恨。
“小智，绝对要让他们受到应有的惩罚！”小霞咬牙切齿的说道。
“小智，我们一定要阻止他们，宝可梦是会痛苦的生命。”莎莉娜的声音颤抖，但清晰，压抑着自己的愤怒。
“原来，由基拉之所以对人关闭心扉，是因为它和它的母亲，被这样无情的拆散了。”
直到现在，她们也理解，为什么由基拉，迟迟不能接受，除小智以外的人的原因。
“唰唰唰…”小智模仿奥特曼中的八分光轮，将波导凝练成型，直接切断这些这些黑色触手。
当黑色的牢笼消散之后，随之出现的，是远处的一点光亮，小智一行人赶紧跑了过去，他们发现，由基拉又变成刚开始那个样子，整个身体蜷缩在一起。
众人刚要靠近的时候，黑色的牢笼拔地而起，小智带着他们往后退，眼看着这黑色的牢笼不断攀升，变成由荆棘组成的高塔。
“那一定是自闭在悲伤记忆中的，由基拉的样子。”小刚分析道。
“由基拉！”在小智呼唤声下，由基拉开始挣扎，扒拉着荆棘，想要逃出来。
小智活动一下身子：“由基拉等我，要上了，皮卡丘，把由基拉从黑暗里带出来。“
“皮卡！”皮卡丘刚往前跳出几步，地上冒出许多黑色荆棘尖刺，小智冷冷一笑，双手连续摆动，五个八分光轮，将这些尖刺全部切断：“你们一起上吧！我在后面掩护。”
“好！”三人一起往前冲。
皮卡丘也是不断使用铁尾，和十万伏特打断这些挡路的东西。
几秒后，小智他们来到由基拉的面前，然而，由基拉却被冰封起来。
小智摸上冰块：“好冰啊，由基拉你尽力了，不用担心，不管是什么人，或者东西，都不可以伤害你，接下来就看我身为训练家我吧。”
而此时的由基拉听到小智的话，眼神也深深的触动，从冰块中睁开自己的眼睛。
小智的右拳，不断凝聚着波导之力：“给我出来吧！”一拳砸在冰块上，冰封破碎之后，由基拉满心欢喜的，跳到小智的怀抱里，这也得亏是小智，换成其他人还真不容易成功。
（健太：我可以让火暴兽凿啊，我的由基拉啊）
白光一闪，那个千疮百孔的蛋恢复正常样子，随后众人再次睁开眼睛，已经回到现实世界。
小智用力抱着由基拉，微笑道：“不要忘了，你还有我们啊。”
“对啊，你还有我们呢。”小霞她们也走了过来，但看着一动不动的由基拉发觉到不对，停下脚步：“该不又变坚硬了吧！”
不过，由基拉随后马上露出笑脸看着她：“呀呀呀。”的笑出声音，小霞也顺利的，拉起它的小手。
小G飘浮着，来到小智和由基拉面前，大眼睛弯弯的，一副很高兴的模样。
“谢谢你帮我解决由基拉的心病。”
小G用觉醒力量把自己的感情传递给小智，大致意思：是你自己解决的，而且是你先帮我的。
此时天空裂开一道紫色裂缝。
“那是！”
“是未知图腾的伙伴来接它了。”
----------
小智开心的笑起来，因为他能察觉到由基拉的开心：“我们是进入神奇宝贝保护区了吧。”
进入这里之后，由基拉就显得非常开心，应该是感觉到了家的气息。
“由基拉，这里就是你出生的故乡了哦！”小霞凑近笑着说道，由基拉已经完全不怕她了，她老喜欢这个可爱的小家伙了。
很快由基拉带起队，大岩蛇和它并排走着，哼着只有它们自己能听懂的歌。
皮卡丘在后面跟着两个小宝宝，避免出什么坏事。
“由基！”
大岩蛇望去，是一棵果树啊，然后看着由基拉摆动两条小短腿，一扭一扭前进，转转眼睛，空气中幽灵系能量汇聚成功，出现一只爪子，超过由基拉，抓在树干上。
“由基！”由基拉感觉自己飞起来，大岩蛇通过这种方式，直接把它们自己撞到树干上，几颗果子直接砸在它们头顶。
小智一伙人看着它们这样，笑出声。
小刚托住下巴别扭的说道：“尽管知道小智的大岩蛇是幽灵加地面的，可是用影子爪的大岩蛇，看着真不熟悉啊。”
于此同时，在不远不近且无人注意的角落，有人看着小智一行人。
后面停着的，正是由基拉梦境中，给它带来阴影的装甲车。
“古尔老大，发现一只由基拉，好像还有一只奇异的大岩蛇，看着样子一定很有价值，加上皮卡丘，不如我们把它们都抓起来。”