永平九年（公元66年 丙寅年）
夏天，四月甲辰日，明帝下诏让司隶校尉、各州刺史，每年上报任职三年以上、政绩特别突出的县令、县长各一人，与上计吏一起送到朝廷，政绩特别差的也要上报。
这一年，粮食大丰收。
明帝赐给皇子刘恭灵寿王的称号，赐给皇子刘党重熹王的称号，但此时他们还没有封国。
明帝非常推崇儒学，从皇太子、诸王侯到大臣子弟、功臣子孙，没有不学习儒家经典的。还为外戚樊氏、郭氏、阴氏、马氏的子弟在南宫设立学校，称为“四姓小侯”学。设置《五经》老师，挑选才学高超的人来教授他们学业。就连期门、羽林的将士，也都要求精通《孝经》的章节句义。匈奴也送子弟来学习。
广陵王刘荆又叫来相面的人，对他说：“我的相貌像先帝，先帝三十岁得到天下，我现在也三十岁了，可以起兵了吗？”相面的人到官府告发了这件事，刘荆很害怕，自己主动把自己关进监狱。明帝对他施加恩典，没有深入追究此事，下诏规定他不能拥有臣属、官吏和百姓，只让他像以前一样享受租税，派国相、中尉严密守护他。刘荆又让巫师进行祭祀，诅咒他人。明帝下诏让长水校尉樊鯈等人共同审理这个案件，事情审理完毕后，樊鯈等人上奏请求对刘荆施以刑罚。明帝生气地说：“你们因为他是我弟弟，就想杀了他。如果是我儿子，你们敢这样吗？”樊鯈回答说：“天下是高帝的天下，不是陛下一个人的天下。按照《春秋》的天下，君主和亲人不能有叛逆的念头，有了就一定要诛杀。我们因为刘荆是陛下同母的弟弟，陛下您心怀圣明，对他有恻隐之心，所以才敢请示您；如果是陛下的儿子，我们直接诛杀就行了。”明帝听了叹息，认为他说得有道理。樊鯈是樊宏的儿子。
永平十年（公元67年 丁卯年）
春天，二月，广陵思王刘荆自杀，封国被废除。
夏天，四月戊子日，大赦天下。
闰月甲午日，明帝到南阳，召集学校的学生演奏雅乐，演奏《鹿鸣》时，明帝亲自吹埙和篪来配合，让宾客们开心。返回途中，又到了南顿。冬天，十二月甲午日，回到宫中。
当初，陵阳侯丁綝去世，他的儿子丁鸿应当继承封爵，丁鸿却上书称病，要把封国让给弟弟丁盛，朝廷没有回复。丁綝安葬后，丁鸿就把丧服挂在墓旁的小屋，然后逃走了。他的朋友九江人鲍骏在东海遇到丁鸿，责备他说：“以前伯夷、吴札，是在乱世采取变通的做法，所以才能实现自己的志向。但按照《春秋》的大义，不能因为家事而荒废国事。现在你因为兄弟之间的私情，而断绝父亲传下来的基业，这样可以吗？”丁鸿听了深受感动，流下眼泪，于是回到封国。鲍骏趁机上书推荐丁鸿精通经学，品行高尚，明帝就征召丁鸿为侍中。
永平十一年（公元68年 戊辰年）
春天，正月，东平王刘苍和各位诸侯王一起来朝见，过了一个多月，才回到封国。明帝亲自送行，回宫后，心中凄然，十分想念，就派使者带着亲手写的诏书给东平国的中傅，诏书中说：“分别之后，我独自坐着不开心，乘车回宫时，伏在车前横木上吟诗，远望你们离去的方向，心中实在牵挂。读到《采菽》这首诗，更增添了我的叹息。之前我问东平王：‘在家做什么最快乐？’东平王说：‘做善事最快乐。’这话意义深远，很符合他的胸怀啊。现在送去列侯印十九枚，各位王子中五岁以上能快走参拜的，都让他们佩戴。”
永平十二年（公元69年 己巳年）
春天，哀牢王柳貌率领他的五万多户百姓归附汉朝，朝廷在他们的土地上设置了哀牢、博南两个县。开始修筑通往博南山的道路，要渡过兰仓水，行路的人都觉得很辛苦，唱道：“汉德广，开不宾；度兰仓，为它人。”
当初，汉平帝的时候，黄河、汴水决口泛滥，很长时间没有修复。建武十年，光武帝想修复它们，浚仪县令乐俊上书说，百姓刚经历战乱，不适合征发劳役，于是就没有动工。从那以后，汴渠水向东泛滥，范围越来越大，兖州、豫州的百姓哀怨叹息，认为官府总是兴办其他劳役，不把百姓的急事放在首位。正好有人推荐乐浪人王景擅长治水，夏天，四月，明帝下诏征发几十万士兵，派王景和将作谒者王吴修筑汴渠堤坝，从荥阳东边到千乘的入海口，长达一千多里，每隔十里就修建一座水门，让河水相互回流灌注，不再有决堤漏水的隐患。王景虽然精简节省了劳役费用，但花费仍然数以百亿计。
秋天，七月乙亥日，司空伏恭被免职；乙未日，任命大司农牟融为司空。
这时，天下太平，百姓没有徭役，年年丰收，百姓生活富足，一石粟只要三十钱，牛羊遍布田野。
永平十三年（公元70年 庚午年）
夏天，四月，汴渠修成，黄河和汴水恢复分流，回到原来的河道。辛乙日，明帝到荥阳，巡视河渠，然后渡过黄河，登上太行山，到了上党；壬寅日，回到宫中。
冬天，十月壬辰日是月底，发生了日食。
楚王刘英和方士制作金龟、玉鹤，刻上文字作为祥瑞的象征。有个叫燕广的男子告发刘英和渔阳人王平、颜忠等人制作符瑞图书，有叛逆的阴谋，明帝把这件事交给有关部门查验。有关部门上奏说：“刘英大逆不道，请陛下诛杀他。”明帝因为亲情不忍心这么做。十一月，废除刘英的王爵，把他流放到丹杨泾县，赐给他五百户的汤沐邑；刘英的子女被封为侯、主的，食邑照旧；允许刘英的母亲许太后不用上交玺绶，留在楚国宫中。之前有人私下把刘英的阴谋告诉司徒虞延，虞延认为刘英是皇室近亲，不相信这些话。等到刘英的事情败露，明帝下诏严厉责备虞延。
评论
永平九年至十三年，东汉在政治、文化、经济、民族关系及宗室事务等多方面呈现出丰富多样的发展态势，对东汉王朝的稳定与发展产生了深远影响。
政治上，通过诏令司隶校尉和刺史上报官吏政绩，明帝加强了对地方官员的考核与管理，旨在选拔优秀官员，淘汰不称职者，以提升政府的行政效能。同时，官员任免的变动，如司空的更替，体现了朝廷对政务管理的动态调整。
文化方面，明帝对儒学的大力推崇，从皇室宗亲到普通将士，乃至匈奴子弟都受其影响学习儒家经典，这不仅促进了文化的传播与传承，更增强了民族凝聚力和文化认同感，为社会稳定和国家治理奠定了思想基础。
经济上，这一时期呈现出繁荣景象，粮食丰收，物价低廉，百姓富足，牛马遍野，反映出社会经济的稳定发展。而汴渠的成功修建，更是一项具有重大意义的水利工程。尽管工程耗费巨大，但解决了长期以来黄河、汴水决口泛滥的问题，保障了农业生产和百姓生活，体现了朝廷对民生的重视和强大的组织能力。
民族关系上，哀牢王率部归附，朝廷设置新县，拓展了疆域，加强了对西南地区的管理与开发，促进了民族融合。但修通博南山道路过程中百姓的歌谣，也反映出大规模工程给民众带来的一定负担。
宗室事务中，广陵王刘荆因谋逆最终自杀，楚王刘英因造作符瑞图书被废，展现出朝廷对宗室叛乱行为的处理态度，既体现了明帝在亲情与国法间的挣扎权衡，也表明了维护政权稳定的决心。而东平王刘苍与明帝之间深厚的兄弟情谊，以及明帝对其“为善最乐”言论的赞赏，从侧面展现出皇室内部积极的情感交流与价值观引导。