在深入遗迹的过程中，他们终于找到了与芯片纹路对应的神秘装置。启动装置后，一道古老的声音响起，告知他们这是对抗幕后黑手的关键力量，但需要用小队成员的部分能量来激活。队员们毫不犹豫，纷纷献出自己的能量。装置发出耀眼光芒，一股强大的力量被唤醒。
与此同时，留在舰队的队员们已快支撑不住。就在敌人即将突破防线时，队长带领小队带着激活的神秘力量赶回。他们将力量融入联合舰队的武器系统，瞬间，舰队的火力得到了质的提升。联合舰队发起反攻，一举击溃了敌人的先头部队。宇宙暂时恢复了平静，但众人明白，真正的决战还在后面。
在短暂的平静中，队长召集队员们开会。“我们虽然击退了先头部队，但幕后黑手肯定不会善罢甘休。”队长严肃地说，“必须尽快找到幕后黑手的老巢。”这时，一位队员指着装置上突然出现的地图，“看，这可能是线索。”众人围拢过去，地图显示在遥远的暗物质星云深处有一个神秘基地。
于是，联合舰队朝着暗物质星云进发。当接近基地时，遭遇了前所未有的强大防御。敌人似乎早就料到他们会来，各种能量护盾和攻击武器不断袭来。舰队陷入苦战，神秘力量虽强大，但面对如此严密的防御也有些力不从心。就在局势危急之时，装置再次发出光芒，竟分析出了敌人防御的弱点。队员们迅速调整战术，集中火力攻击弱点，终于突破了防线，一场真正的决战即将在这神秘基地展开。
联合舰队成功突破防线，冲进了神秘基地内部。然而，里面的景象让众人倒吸一口凉气，无数机械怪物从四面八方涌来，它们动作敏捷，攻击凌厉。队员们操控着战舰与怪物展开激烈战斗，一时间枪炮声、喊杀声震耳欲聋。
就在战斗胶着之际，幕后黑手现身了。他竟是一位融合了高科技与黑暗力量的神秘存在，周身散发着诡异的气息。他轻蔑地看着众人，大手一挥，更多的机械怪物疯狂扑来。
队长深知不能再这样僵持下去，他下令启动神秘装置的隐藏功能。装置光芒大盛，释放出一股净化之力，机械怪物在这股力量下纷纷瓦解。
幕后黑手见状，恼羞成怒，亲自出手攻击舰队。队员们齐心协力，用神秘力量凝聚成一道强大的护盾，抵挡住了他的攻击。紧接着，他们找准时机，发动致命一击，将幕后黑手击败。神秘基地开始崩塌，联合舰队迅速撤离，宇宙又恢复了往日的和平。
就在大家以为一切都结束的时候，那被击败的幕后黑手竟并未完全消亡。他的一丝残魂附着在神秘装置上，趁众人不备，操控装置启动了自毁程序。警报声瞬间响彻联合舰队，倒计时疯狂闪烁。队长当机立断，命令舰队迅速远离基地残骸。