起源星重建工作如火如荼进行时，宇宙深处的异常波动再次打破了短暂的平静。联盟总部的能量监测系统突然发出刺耳的警报，数十个星系同时出现诡异的能量共振现象。这些能量波动既不同于混沌主宰的黑暗力量，也非起源星的本源之力，反而像是某种未知文明留下的特殊信号，在星际间以诡异的频率震荡。
“这些能量波动正在形成规律的脉冲序列！”艾瑞克盯着不断跳动的全息数据，指尖在操作面板上快速滑动，“每个脉冲间隔精确到纳秒级，明显是人为操控的结果。”林昊凑近屏幕，眉头紧锁——那些能量波纹在星图上勾勒出复杂的几何图案，宛如宇宙深处睁开的神秘眼眸。搞笑大师罕见地收起玩笑，将一个微型探测器抛向空中：“我在三个星系外检测到类似频率，这股力量似乎在绘制某种星际坐标。”
为了查清真相，林昊率领小队驾驶新型星际战舰“曙光号”前往能量波动最强烈的区域。当战舰突破星云屏障的瞬间，众人被眼前的景象震撼：无数发光的晶体悬浮在虚空中，它们表面流转着彩虹般的光晕，彼此之间由细密的能量丝线相连，组成一个庞大的立体矩阵。这些晶体正在以肉眼可见的速度生长，每当新的晶体诞生，整个矩阵就会发出共鸣般的嗡鸣。
“这是某种能量培育系统！”苏璃操控金色丝线捕获了一块晶体碎片，“这些晶体能吸收周围的暗物质和宇宙辐射，将其转化为...”她突然顿住，眼中闪过惊恐，“不好！它们在制造反物质！”话音未落，矩阵中心爆发出剧烈的能量冲击，数百块晶体同时湮灭，产生的反物质爆炸形成吞噬一切的微型黑洞。林昊紧急启动曲率引擎，在黑洞完全成型前带领战舰脱离危险区域。
惊魂未定之际，战舰的通讯系统突然接入一段加密信号。画面中浮现出一个由光粒子组成的模糊人形，声音经过多重变调处理：“宇宙的闯入者，你们不该触碰不属于你们的文明遗产。”林昊握紧剑柄：“你们是谁？制造反物质矩阵想做什么？”对方发出冰冷的机械笑声：“这是维系宇宙平衡的必要手段。你们所谓的和平，不过是掩盖熵增的假象。当文明发展到临界点，唯有重启才能避免毁灭。”
信号中断后，小队陷入沉默。艾瑞克调出古老的星际文献，声音带着颤抖：“我曾在远古遗迹的石刻中见过类似描述——每隔十万年，宇宙就会出现‘熵值清算者’，它们认为过度繁荣的文明会加速宇宙的热寂，必须通过大规模毁灭来重置一切。”搞笑大师掏出“频率干扰仪”，却发现设备在剧烈抖动：“这些家伙的科技远超我们想象，普通武器根本没用！”
此时，起源星传来紧急消息：重建中的能量核心出现异常共鸣。林昊等人立刻返程，发现起源星表面浮现出与能量矩阵相同的几何纹路，星球核心的本源之力正在被某种力量牵引，形成巨大的能量漩涡。混沌主宰的残党趁机发动袭击，无数黑暗机械生物从亚空间涌出，目标直指起源星的能量核心。
“分头行动！”林昊挥舞光剑斩碎迎面扑来的机械章鱼，“艾瑞克，你负责稳定起源星核心；苏璃，用金色丝线干扰能量纹路；搞笑大师，想办法破坏混沌残党的指挥中枢！”激烈的战斗中，林昊发现这些机械生物的关节处镶嵌着与能量矩阵相同的晶体，它们似乎在利用晶体吸收战场能量，转化为更强大的攻击。
关键时刻，搞笑大师掏出最新发明“维度错位弹”。这种武器能暂时扭曲局部空间，将敌人传送到随机维度。随着一连串爆炸，混沌机械大军的阵型被打乱。艾瑞克则在核心区发现了隐藏的能量接收器——有人在利用起源星的本源之力，为宇宙深处的能量矩阵充能！
当林昊斩断最后一只机械生物的瞬间，天空中突然出现巨大的投影。那个神秘存在再次现身，这次显露出完整的形态：它是由纯粹的能量构成的类人生物，周身环绕着星云般的光晕。“你们的抵抗毫无意义。”它的声音带着星辰崩塌的威严，“起源星的力量是重启计划的关键，它将引发足以摧毁半数星系的超新星爆发，这是宇宙重生的代价。”
林昊举起融合了起源星之力的光剑，金色光芒照亮整个战场：“宇宙的命运不该由你们决定！文明的价值在于不断抗争，而不是被动接受毁灭！”他纵身跃起，光剑与神秘存在的能量触手激烈碰撞。每一次交锋都引发空间震荡，苏璃趁机用金色丝线缠住对方的能量核心，搞笑大师则将维度错位弹精准投入能量漩涡。
就在局势胶着之时，艾瑞克在起源星核心发现了惊人秘密——远古时期的守护者曾留下对抗熵值清算者的程序。他迅速将程序注入能量网络，起源星表面的几何纹路开始逆向运转，释放出净化之力。神秘存在发出愤怒的嘶吼，它的能量体开始崩解，而那些能量矩阵也在净化波的冲击下纷纷瓦解。
战斗结束后，起源星的能量核心恢复稳定，但宇宙的危机并未真正解除。林昊等人在废墟中找到一块破损的晶体，上面刻着奇怪的文字：“清算者永存，文明在轮回中挣扎...”这暗示着他们将面对更强大的敌人，而宇宙深处，还有无数未解之谜等待揭晓。
“看来和平只是暂时的奢侈品。”苏璃望着重新亮起的起源星，轻声说道。林昊握紧光剑，目光坚定：“但只要我们还在，就不会让文明的火种熄灭。下一次，我们会准备得更充分。”星空依旧浩瀚，而宇宙守护者们的征程，才刚刚开始。