云城的重建工作如火如荼，起重机的轰鸣声中，姜辰戴着普通安全帽穿梭在工地间。失去守护者力量的他，身体时常会感到隐隐作痛，但眼神却愈发坚毅。苏梓凝的平板电脑突然弹出紧急通讯，画面里张小柔的战术目镜闪烁着红光：“发现异常能量波动！坐标正是当日银舰消失的海域！”
三人连夜乘船抵达目标地点，深海探测仪显示下方千米处存在巨型金属结构。姜辰穿上特制潜水服，与张小柔一同潜入。水压挤压着耳膜的剧痛中，他们终于看清——那艘银色飞船正安静地躺在海沟底部，船身的纹路在幽蓝海水中泛着神秘的光，而更令人心惊的是，船舱外漂浮着数十个与姜辰长相相似的休眠舱。
“克隆体...”张小柔的声音通过通讯器传来，带着难以掩饰的颤抖。她的狙击枪瞄准最近的舱体，却发现玻璃上布满细密的文字，那些符号与终局密钥上的宇宙符文如出一辙。还未等他们有所行动，飞船的舱门突然自动开启，一道光束将两人吸入其中。
与此同时，云城苏氏集团总部，林星的备用机械义体突然启动。她的眼睛闪过紫光，机械臂从暗格里取出一枚芯片，上面刻着“x先生残党”的字样。“计划进入第二阶段。”她的声音冰冷，手指在键盘上飞速敲击，整个城市的量子网络开始出现诡异波动。
被吸入飞船的姜辰和张小柔醒来时，发现身处一个布满全息星图的舱室。墙壁上的投影正在循环播放：初代议长在创造观测者议会前，曾与一个更古老的文明达成协议，而这艘银舰，正是那个文明留下的“火种容器”，用于在宇宙重启时保存文明的种子。但画面突然扭曲，出现了黑袍人篡改记录的场景——他抹去了关于“古老文明”的所有信息，并将飞船藏匿。
“原来如此，叛党一直在寻找的不是毁灭，而是取代。”姜辰握紧拳头，身体因激动而微微颤抖。他的银色徽章突然发出微弱的光芒，这是失去力量后首次出现异动。飞船的主控系统突然启动，一个柔和的女声响起：“检测到守护者血脉，欢迎回来，第72代文明传承者。”
舱门打开，两人进入核心区域，看到了震惊的一幕——中央的能量柱上，插着一把与终局密钥相似的钥匙，而柱子周围，悬浮着十二个刻满不同文明图腾的立方体。飞船AI解释道：“这些是宇宙各个纪元的文明火种，只有集齐三把钥匙，才能真正激活‘文明熔炉’，实现无代价的宇宙重构。”
就在此时，飞船突然剧烈震动。林星的全息投影出现在船舱内，她的身后跟着一群机械守卫：“姜辰，把火种交出来。‘x先生’的残党可不会因为你失去力量就放过你。”她的机械臂展开成粒子炮，瞄准姜辰的胸口。
千钧一发之际，张小柔的狙击枪率先开火，子弹却被林星轻松偏转。姜辰挡在张小柔身前，银色徽章的光芒愈发强烈：“你以为拿走火种就能掌控一切？初代议长的下场还不够让你们清醒？”他的话音未落，船舱外传来熟悉的能量波动——维度监察使的舰队正在逼近。
林星的表情首次出现慌乱：“不好，监察使收到了错误指令，他们要摧毁这里所有的文明痕迹！”她的机械臂快速操作控制台，试图启动飞船，但能量柱却突然闪烁红光。AI的声音变得急促：“检测到外部能量冲击，自毁程序启动，倒计时10分钟！”
姜辰看着能量柱上的钥匙，又看向悬浮的文明火种，突然做出决定。他将手放在能量柱上，银色徽章的光芒与钥匙产生共鸣，十二个立方体自动飞入他的掌心。“张小柔，启动逃生舱！”他大喊，“我来拖住他们！”
“不行！我不会再让你独自冒险！”张小柔举起狙击枪，却被姜辰打晕。他将她放入逃生舱，自己则冲向飞船主控室。在飞船爆炸的前一刻，他带着文明火种传送到海面，却发现监察使的舰队已经封锁了整片空域，而林星的机械舰队正在与他们交火。
“为什么要帮我们？”姜辰通过通讯器质问林星。她的机械臂在炮火中划出弧线：“因为我受够了被操控的人生。而且......”她的声音顿了顿，“你体内的守护者血脉，似乎唤醒了我残留的人性。”
战斗正酣时，天空突然裂开缝隙，一个巨大的身影从中走出——那是由暗物质构成的巨人，胸口镶嵌着与古书同源的装置。他的声音如同雷鸣：“文明的蛀虫们，接受熵寂的审判吧！”姜辰握紧手中的文明火种，他知道，真正的挑战，才刚刚开始。