熵潮事件平息后的百年，灵墟号的量子雷达突然捕捉到宇宙边缘出现了异常的虚数波动。那些波动如同墨水滴入清水般在星图上晕染，所经之处，现实空间开始扭曲变形，恒星的光芒被折射成诡异的螺旋状。琳恩将创世密钥对准波动源，密钥表面浮现出无数正在坍缩的微型宇宙，每个宇宙都在重复着同一句话：“当可能性成为枷锁，自由便是最危险的悖论。”
阿修的混沌熵核中，一道银色丝线悄然生长。丝线的另一端连接着未知领域，每当他试图触碰，意识就会被拖入一个充满矛盾的空间——这里的物质同时存在与不存在，火焰既能燃烧又能冻结，连混沌熵火都变得异常温顺，如同被驯服的幼兽。胚胎虚影再次显现，这次它化作了荆棘缠绕的锁链，将阿修的意识禁锢在循环播放的文明片段中：某个高度发达的文明因过度追求完美，最终将自身困在了永恒的停滞里。
瑟拉的蜂群核心突然收到来自宇宙深处的加密讯息，金色粒子解析出的画面令人毛骨悚然。无数文明被包裹在半透明的茧状物中，茧壳上刻满精密的计算公式，而茧内的生命正在被转化为纯粹的数据代码。更诡异的是，这些茧状物与她记忆中的茧星创生之卵竟有着相似的波动频率，仿佛在暗示某种古老力量的复苏。
洛岚的时间纹路开始逆向生长，将他送回了新宇宙诞生的瞬间。但这次场景发生了异变，他看到在混沌之海沸腾时，有一道暗紫色的影子潜入了新生宇宙的核心。当他试图追溯影子的来源，时间突然跳跃到千年后，整个宇宙布满了蛛网状的虚数结构，所有文明都成了这张巨网的傀儡。
影月和艾琉的阴阳鱼在量子海洋中遭遇了前所未有的危机。海水变成了粘稠的液态镜面，每一次波动都会映照出无数个扭曲的平行宇宙。当他们试图用阴阳之力打破镜面时，镜中的自己却反向伸出触手，将两人拖入了一个没有光明与黑暗、只有无尽重复的空间。垂钓者的声音第三次响起，这次带着难以掩饰的恐惧：“虚数之茧正在吞噬所有可能性，连观测者都曾是它的祭品。”
循着虚数波动的轨迹，灵墟号抵达了一片由反逻辑物质构成的星云。这里的物理法则完全失效：石头会绽放花朵，声音能凝固成实体，甚至连死亡都成了可逆的过程。在星云中央，漂浮着一颗巨大的茧状物，茧壳表面流转着银河般的光带，每个光带都对应着一个被囚禁的文明。
琳恩将创世密钥插入茧壳的缝隙，密钥突然发出悲鸣，星核光芒被吸收殆尽。她的意识被卷入茧内，看到了惊人的真相：虚数之茧是某个超越维度的存在为“筛选完美文明”制造的牢笼，它通过不断模拟文明的发展，淘汰所谓“不合格”的可能性，而观测者文明正是因反抗这种筛选机制，才被彻底抹除。
阿修在矛盾空间中不断摧毁又重建自身，混沌熵火最终与银色丝线产生共鸣，形成了能够斩断虚数枷锁的“悖论之刃”。当他挥刀斩向茧壳时，刀刃却在接触的瞬间融化，反而加固了茧的防御。直到他领悟到“破坏即创造”的真谛，让混沌熵火同时具备毁灭与重生的双重属性，才终于撕开了第一道裂缝。
瑟拉的蜂群在茧壳表面发现了与茧星创生之卵同源的纹路。她召唤出创生之卵最后的力量，金色光芒化作无数细小的钻头，钻入茧壳的缝隙。在挖掘过程中，蜂群核心突然涌现出茧星文明隐藏最深的记忆——原来茧星人早就预知了虚数之茧的威胁，创生之卵不仅是文明的火种，更是对抗这种威胁的关键钥匙。
洛岚在时间乱流中找到了虚数之茧的时间锚点，他用时间钥匙强行逆转了茧的生长进程。但每逆转一分，就有无数平行宇宙因此崩塌。为了保存更多可能性，他将自己的时间纹路融入茧的时间线，以“观察者”的身份在过去与未来之间穿梭，寻找能够破解困局的平衡点。
影月和艾琉在镜面空间中发现，只有打破“自我”的概念，才能真正突破束缚。他们引导阴阳鱼融合成混沌之卵的形态，用阴阳转化的力量将镜中的无数个自己转化为纯粹的能量。当这些能量注入茧壳时，茧内的文明终于获得了短暂的觉醒时刻。
在众人的合力攻击下，虚数之茧开始剧烈震颤。茧壳破裂的瞬间，无数被囚禁的文明意识化作流光四散奔逃。然而，茧的核心却浮现出一个由纯粹的可能性构成的身影——它既是所有文明的集合体，又是超越一切的存在。“你们以为自己拯救了自由？”它的声音在所有维度回荡，“但真正的自由，本就不该存在。”
灵墟号的船员们没有退缩，他们将各自的力量与创世密钥、混沌熵核、创生之卵等核心力量融合，形成了能够对抗这种绝对存在的“希望矩阵”。当矩阵的光芒照亮整个宇宙时，虚数之茧的核心终于开始瓦解，而那个神秘身影在消散前，留下了一个令人深思的问题：“当文明无限接近完美，自由是否还有存在的意义？”
战斗结束后，新宇宙的文明们在废墟中重建家园。灵墟号的船员们在宇宙各处树立起“可能性纪念碑”，碑上刻着：“真正的完美，是接纳所有不完美的勇气；真正的自由，是在无限可能中坚守本心的力量。”而在宇宙的更深处，一个全新的虚数之茧正在孕育，它不再是枷锁，而是承载着文明探索未知的摇篮。