以荷兰为首的西方联合舰队在马六甲海域被明北洋水师第二舰队提督王锦世率领的莱州号战舰鸣炮示警，由于王锦世只率领一艘战舰远航马六甲，所以只是警告了一下联合舰队便返航了。
联合舰队到了爪哇岛海域，停靠在巴达维亚，集齐所有一百多艘舰船后，准备开往吕宋岛的马尼拉，给明水师以毁灭性的打击。
王锦世向郑成功汇报了荷兰等国舰队通过马六甲的情况，郑成功立即命令王锦世率莱州号、临清号、济南号三艘战舰前去驰援马尼拉。
南洋水师大都督卢师准，也是吕宋的大都督对荷兰联合舰队的情报了解的一清二楚。
从舰艇数量上来看，卢师准的水师的舰艇数量远远低于联合舰队。
但从舰艇质量上来比较，联合舰队的舰艇与明水师的舰艇不处在一个维度，明水师完全可以吊打他们。
海战，一定要在海里战的，卢师准下令：南洋水师全师出动，目标是爪哇岛的巴达维亚，卢师准要将联合舰队堵在老巢里打。
风云际会。
永昌十八年（1664年）十月十七日，爪哇海加里曼丹岛西北海域（北纬3°12'，东经110°45'）。
晨雾未散，荷兰联合舰队统帅威廉·范·德·霍根站在旗舰“海上雄狮号”甲板上，单筒望远镜扫过灰蒙蒙的海面。这位四十六岁的弗里斯兰老将，左脸刀疤在晨光中泛着暗红。昨夜斥候快船已探得明军动向——南洋水师主力竟离开马尼拉，直扑巴达维亚！
“卢师准疯了吗？”西班牙分舰队司令迭戈·德·科尔多瓦**侯爵扯开金边斗篷，露出腰间镶满红宝石的佩剑，“放着马尼拉不守，来打我们老巢？”
英格兰统帅罗伯特·布莱克擦拭着银制圣经挂坠，冷笑：“明国人想复制吕宋战术，但巴达维亚不是马尼拉。”他指向海图，“这里水道交错，暗礁密布，正是歼灭铁甲舰的绝佳战场！”
范·德·霍根独眼微眯。他何尝不知爪哇海凶险？但联合舰队一百二十艘战舰中，仅有十艘新式铁甲舰，其余皆是木壳风帆船。此刻了望塔突然传来惊呼：“东南方发现黑烟！”
明军的碾压攻势。
三十海里外，南洋水师旗舰“镇远号”舰桥上，都督卢师准手握黄铜传声筒，声音冷冽如铁：“全舰队展开雁形阵，蒸汽轮机增压至八成！”这艘排水量五千吨的巨舰，八座锅炉同时咆哮，烟囱喷出的煤烟在空中拖出黑龙般的轨迹。
副将朱可贞紧盯测距仪：“敌舰队呈松散纵队，荷兰铁甲舰在前，西班牙大帆船居左，英国战舰拖后——典型的诱敌深入阵型。”
“雕虫小技。”卢师准冷笑，“传令：第一舰队绕至加里曼丹岛西侧，切断退路；第二舰队正面佯攻；主力舰队随本督直插敌阵中央！”
随着旗语翻飞，明军战舰分成三股钢铁洪流。最引人注目的是十二艘铁甲舰，这些装备五十门150mm后膛炮的怪物，此刻炮口全部指向西北。
死亡三海里：降维打击。
“距离十二链（约2.2公里）！”测距兵高喊。这个距离远超欧洲战舰射程，但卢师准已举起令旗：“放侦察艇！”
二十艘快艇从母舰滑入海中，每艘载有三人观测小组。他们如离弦之箭冲向前方，在浪尖颠簸中架起光学测距仪——这是大明工部最新研制的“千里镜”，可将坐标误差控制在三十米内。
“敌旗舰坐标：东经110°43'，北纬3°15'，风速三级偏西！”首艇观测员挥动信号旗。信息通过闪光灯编码传回“镇远号”，炮术长飞速转动计算罗盘：“仰角22度，方位西北偏西！”
“开火！”卢师准挥落令旗。
“轰——！！！”
“镇远号”右舷四十门主炮齐射，苦味酸炸药推动的尖头穿甲弹撕裂空气。范·德·霍根只见天际亮起数十道火线，还未及反应，“海上雄狮号”前甲板便炸开冲天火球。4英寸锻铁装甲如纸片般撕裂，荷兰旗舰的船艏像被巨兽啃食，破碎的青铜狮头坠入海中。
炼狱时刻：联合舰队的崩溃。
“上帝啊！他们能在三海里外开火！”英国铁甲舰“皇家勇士号”上，布莱克眼睁睁看着前方三艘西班牙大帆船化作火团。木质船身在爆炸中解体，带着七百名水手沉入爪哇海。
科尔多瓦侯爵的旗舰“圣特立尼达号”更惨——这艘载有八十门炮的巨舰，被两发炮弹同时命中弹药库。三百吨火药被引爆的瞬间，冲击波掀翻了邻近的荷兰快舰“飞鱼号”，漫天飞舞的碎木中，可见镶金边的圣地亚哥勋章在空中翻转。
“转向！转向！”范·德·霍根捂着血流如注的右臂嘶吼。但为时已晚，明军第二舰队已包抄到位。二十四艘“福州级”巡洋舰喷吐火舌，速射炮以每分钟十五发的速度倾泻弹雨。荷兰铁甲舰“泽兰省号”试图还击，但32磅前膛炮的实心弹打在明舰装甲上，只留下浅浅凹痕。
兵败如山：欧洲人的逃亡。
战至午时，爪哇海已成修罗场。联合舰队损失过半，海面上漂浮的残骸延绵十余里。幸存的荷兰铁甲舰“弗里斯兰号”甲板上，范·德·霍根独眼血红：“传令…撤退…”
这道命令引发连锁崩溃。西班牙舰队率先掉头，科尔多瓦侯爵的副舰“圣母号”慌不择路撞上暗礁；英国战舰“胜利号”升起白旗，却被明军巡洋舰“漳州号”一炮轰沉……
“去锡兰！去锡兰！”布莱克在“皇家勇士号”上咆哮。残存的三十余艘战舰绕过加里曼丹岛，狼狈逃向马六甲海峡。他们甚至不敢回巴达维亚——了望兵报告，明军第三分队已出现在爪哇岛方向！
巴达维亚陷落：帝国的黄昏
十月十九日清晨，当卢师准的舰队出现在巴达维亚湾时，荷兰东印度公司总督安东尼·范·迪门正将机密文件投入壁炉。火光照亮他残缺的右手——二十年前在澳门被明军炮火所伤，如今历史重演。
“总督阁下，快上船！”卫队长强行拽他走向密道。但为时已晚，明军陆战队在朱可贞率领下，已攻破棱堡南墙。三百“火龙兵”手持火焰喷射器开路，殖民者苦心经营百年的城墙在高温中崩塌。
范·迪门被俘时，正试图用佩剑刺穿东印度公司旗帜。朱可贞夺过断剑冷笑：“省点力气，你的审判将在南京进行。”
错过的决战：王锦世的遗憾
同日午时，北洋水师分舰队司令王锦世站在“莱州号”舰桥上，望远镜中的马尼拉港平静无波。两艘西班牙旧舰“圣安娜号”“圣胡安号”升起明黄龙旗，懒洋洋地巡逻。
“卢都督把仗打完了？”王锦世一拳砸在罗盘上。这位胶东汉子满脸络腮胡颤抖着：“传令！全速赶往巴达维亚！”
但当“莱州号”抵达爪哇海时，只见荷兰战旗在烈焰中坠落。卢师准的南洋水师正在清理战场，海面上漂浮的欧罗巴战舰残骸，仿佛在诉说一个时代的终结。
战后余波：新秩序的诞生
战果统计：
击沉敌舰89艘（含10艘铁甲舰）
俘获23艘（含完整荷兰铁甲舰“弗里斯兰号”）
毙伤敌军两万三千人
明军仅损补给船一艘，阵亡一人
永昌帝诏书：
“设爪哇行省，辖巴达维亚、苏门答腊等地。擢卢师准为南洋经略使，节制南海诸岛。各邦商船须向大明市舶司申领龙旗，违者以海盗论处！”
在马尼拉总督府改建的南洋都护府内，卢师准抚摸着缴获的荷兰海图，对朱可贞叹道：“今日我们碾碎的是舰队，来日要碾碎的，是欧罗巴人染指东方的野心！”
卢师准看向大海，新下水的“永乐号”铁甲舰正在入列。这艘排水量为八千吨的巨舰装备八十门巨炮，它的阴影投向海洋深处——那里，更大的风暴正在酝酿……