刑侦队长林刚在调查薛晓琪的宿舍室友时，她的室友反映说：薛晓琪很有可能是在东大附近的书店认识了什么人，她的遇害可能同那个人有关。
林刚对薛晓琪在书店认识接触的人进行调查和了解，并找到了其室友说的那个人，经过详细的调查，发现那个人并没有作案动机和时间，也就排除了那个人的嫌疑。
林刚把侦查范围放在薛晓琪失踪前的那个晚上，发现薛晓琪失踪当晚，她所在大学宿舍因为有人违规使用电器被发现并处罚。薛晓琪因为是宿舍长，所以也被批评处罚了。
薛晓琪很可能是无缘无故挨批受罚，心情不好一整天都呆在宿舍里。直到傍晚时分才离开宿舍走出校门，之后失踪被害。
林刚围绕受害人进行调查，可查来查去发现根本就找不到什么有破案价值的线索，案件也由此陷入困境，这让林刚十分苦恼。
林刚一边抓紧时间严密排查东海大学附近及抛尸地附近居民，一边寄希望于刑侦队的法医能在碎尸和包裹尸体的旅行袋上找到线索。
但是，由于犯罪嫌疑人太过残暴。将薛晓琪的尸体肢解得太碎，而且还将尸块煮过，即使很多痕迹都没有留下。
法医通过内脏检验结果发现，薛晓琪应该不是失踪当天被人杀害，而是在失踪几天后死亡，法医推断的薛晓琪的被害时间大约在一月十四日至一月十六日之间。
同时，法医通过薛晓琪的内脏检查出，薛晓琪在失踪时间内应该没有吃过食物。
林刚想被害者是在什么情况下，会连续几天不进食？有一种可能，那就是薛晓琪被人绑架或者被犯罪嫌疑人囚禁了。
另外，林刚在其中的一个抛尸包裹中，发现了细微的管型印记和黑火药残渣，林刚怀疑那个装尸块的包裹很可能装过猎枪。
根据这条线索，林刚猜测薛晓琪很有可能是被猎人杀害的。于是，林刚便围绕这条线索展开侦查，但查来查去始终没有发现嫌疑人的踪迹。
东海大学附近几乎遍布各种餐饮饭店，以及老式居民单元楼，整片区域是东海市人口最密集的地区。人员复杂，排查难度极大。
东海警局调集所有警员，对抛尸地点附近的住户和租户，进行挨家挨户走访。林刚分析，犯嫌疑人把薛晓琪的尸体肢解并切成二千多片，那么肯定存在分尸现场。
林刚要求走访的警员在入户调查的时候，对卫生间，浴缸比较大的住户进行更加仔细的检查。
东海大学附近及抛尸点附近的住户都被检查了一次，对重点怀疑对象进行隔离调查，对有劣质的前科人员专门进行单独封闭审查，但是结果都是毫无所获。
案发后三个月，林刚组织警力几乎对东海大学附近掘地三尺，可仍然没有找到东大碎尸案的侦查线索，案件由此陷入僵局。
随后几年，刑侦队长林刚对碎尸案一直没有放弃侦查，但犯罪嫌疑人太狡猾了，做的案子几乎完美无解，直到林刚调离东海警局刑侦大队，东大碎尸案终于成了悬案。
东大碎尸案一直悬在了薛晓琪的家人的心中，而且这一悬就是二十五年，成了龙国十大悬案之一的第一大悬案。