在真新镇附近的山区深处，小智带着小刚和小霞以及娜姿进行艰苦的修行，为即将到来的宝可梦联盟石英大会做准备。一次偶然的机会，他们的训练打破了沉寂，皮卡丘的一次放电竟然劈中了沉睡于山脉的超古代宝可梦文明。
由怀特博士带领的考古团队一直在挖掘这片土地的神秘之处。不久，被公之于众的，是一件寄宿着恐怖超古代宝可梦力量的器皿——金色之眼。现在，它正静静躺在他们露营的帐篷之中。小智轻轻拍了拍腰间的小恶魔，那是他召唤重低音大胖丁的关键。只有它才能平衡即将毁灭世界的两股力量。
小智躲在帐篷外，将皮卡丘藏在外套之中，只露出一个小脑袋，静待火箭队的到来推动剧情发展。这时，帐篷内突然传来一阵微光，金色之眼开始散发出妖异的金色光芒，微微震动。
就在这时，“沙沙沙……”的声音响起，武藏和小次郎这两个小鬼头悄悄摸进了发掘营地的帐篷附近。“为了防止世界被破坏……为了守护世界的和平……”他们的口号在空气中回荡。喵喵在一旁焦急地催促他们寻找宝物。然而，看到那辆停在一旁的车子里似乎有很多人熟睡，小次郎开始犹豫起来。
“四不四傻？”武藏轻蔑地撇撇嘴：“最先冒出来的，多半是些微不足道的物件。真正的珍宝，总是压轴登场！”
“呼唤吧，阿伯怪！”武藏的阿伯怪，那只擅长挖掘的宝可梦，终于迎来了它的时刻。“阿伯怪，钻入地心，寻觅那无上的至宝，将其带回！”
“啾啾！”阿伯怪应命，一头扎入地底。
“呵呵，这下可以悠然等待佳音了。”武藏嘴角上扬，流露出一丝得意。“小次郎，你得到宝物后，有何打算？”
“我嘛……首先得清偿债务。”小次郎语气略显迟疑。
偷听的小智忍不住笑意，心中感慨：小次郎，你真是个善良的人。
“真是的！”武藏有些不悦，“你就不能畅想一下吗？比如买下一两座南方的小岛，尽享悠闲生活。”
“噢，原来如此。若是得到宝物，我便无需为升职加薪而烦恼，可以直接执掌大权了！”
随即，这两个社会底层的打工者开始了无尽的幻想。
“你执掌公司，你加冕为王，你荣升董事，你成为房东……”喵喵听着，不禁摇头叹息：“唉，这就是打工人的无奈啊。”
突然，阿伯怪从一侧山壁中破墙而出。
“哈哈！看来收获颇丰！”武藏惊喜交加。
小智迅速取出图鉴相机，按下快门。
咔嚓！果不其然，阿伯怪口中衔着两颗较大及一颗较小的黑色珠子，那些珠子极有可能是超古代耿鬼的舍利子……
阿伯怪嘴中的那颗珠子引起了小次郎和喵喵的疑惑：“这就是所谓的宝物吗？”就连一向沉稳的武藏也不禁好奇起来：“难道这珠子里没有其他更为璀璨夺目的宝物吗？”
然而，小智却明白眼前这看似普通的珠子非同寻常在此之前，他其实早已思考过，若是缺少了胖丁的力量，该如何应对这两个拥有毁灭力量的超古代宝可梦。在他心中，最稳妥的方式便是将这两个封印道具交给坂木，让火箭队去应对这两个强大的存在。然而，这些都只是他的设想而已。
此时，珠子突然闪烁起妖冶的红色光芒，将阿伯怪吞噬其中。这一幕让小智感到一阵头皮发麻，他不禁猜测这个古老的幽灵宝可梦是否是通过吞噬生物来获取力量。与此同时，营地内的另一个金色之眼也开始变得异常活跃，巨大的脚印在黑暗中显现。火箭队三人组被黑色珠子所吸引，成为了其力量的养分。然而，似乎吞噬的能量还不足以支撑它完全现身，珠子沿着河流漂流了一段距离后，最终在营地上空缓缓落下。面对这只喜怒无常且可能吞噬一切的超古代宝可梦，小智选择了暂时观望的态度。他并不想贸然卷入这场未知的风波之中。
随着夜色的消逝，清晨的曙光照亮了大地。发掘队的人们很快发现了营地中的不寻常之处。明显的巨大脚印，以及那三颗闪烁着的黑色珠子，它们的存在无法被忽视。
“博士，你觉得这些珠子是否象征着某种未知的力量？”考古队的团长蹲在地上，带着好奇与敬畏的目光，手套下的手指轻轻触碰着冷硬的珠子。
“立即将其带走分析。”怀特博士冷静地吩咐，眼神中透露出严肃。
在老团长的手中，其中一颗黑色珠子突然亮起，伴随着一声惊呼，红色的光芒瞬间爆发，团长消失在了众人的视线之中。
“快跑！”小智的声音在空气中回荡，带着不容置疑的紧迫。
众人如梦初醒，纷纷逃离。然而，除了小智一行人及怀特博士外，其他的考古队员都成为了那黑色珠子的祭品。
小智他们躲在房车内，透过窗户观察外界的变化。随着珠子的力量逐渐显现，巨大的耿鬼露出了它的真面目。它已经超越了普通的耿鬼，变得更加庞大与强大。
这时，怀特突然发出尖叫。小智回头一看，车内的物品和金色之眼都在半空中漂浮。他果断地将金色之眼和钥匙一同扔出了房车。
“不要！”怀特惊呼，声音中透露出不舍。
“安全至上！”小智语气坚定，不容置疑。在这关键时刻，他毫不犹豫地做出了正确的选择。
“天哪，眼前这巨大的影子，莫非是耿鬼？”小刚震惊地紧贴在房车的窗户旁，简直不敢相信自己所见的一切。
“世间竟有如此之巨的耿鬼吗？”小霞的心绪已然无法平静。
然而，小智却镇定自若，“这是正常现象。超古代宝可梦的大小远超我们的想象，就如同那只曾在灯塔遇见的快龙。”他的话让小刚和小霞瞬间恍然大悟。
那巨大的耿鬼缓缓抬起双手，周围的世界仿佛被黑暗吞噬。天空被染成了一片漆黑。
“黑暗笼罩天际，如同夜幕降世。”小智轻声低语，这是石板上所记载的描述，眼前的景象仿佛正是答案的展现
说完，小智不再理会怀特，迅速拿起图鉴，为这巨大的耿鬼拍摄照片。他目光坚定，似乎知道接下来的行动方向。
“不仅如此，它正朝山下移动，目的地是真新镇！”小智看着耿鬼留下的足迹，没有丝毫犹豫，冲出房车，紧紧握住手中的金色之眼。
面对小智的行动，小霞和小刚不解地问道：“小智，你打算怎么做？”小智回应道：“超古代宝可梦的力量远超普通宝可梦，为了与之抗衡，我们必须使用同样强大的超古代宝可梦！”他眼中闪烁着坚定的光芒。小智深吸一口气，准备向金色之眼伸出他的手。他深知这将是异常艰难的尝试，因为他的大脑仿佛能感受到一股强烈的压迫感袭来。那是上位超能力者对下位超能力者的精神力量冲击造成的痛苦感受。如果不是小智是一位实力强大的超能力者，恐怕靠近金色之眼就会被完全控制。
\"愤怒至极，我明白了，现在正是释放你的时刻！\"小智大喝一声，随即迅速抓起金色之眼与汤匙，毫不犹豫地将汤匙插入金色之眼中
刹那间，一道炫目的金色光芒爆发而出，照耀四周。一只身形巨大的胡地，宛如从远古走来的巨兽，赫然出现在巨大耿鬼的眼前。其威严与力量令耿鬼也不得不暂时停下脚步，忌惮地注视着眼前的对手。
解放了超古代胡地的小智，此刻却痛苦地捂住头部，瘫倒在地。一股强烈的剧痛侵袭而来，仿佛是被一股金色的意志力深深烙印在精神之中。
这股意志力并未随着胡地的召唤而消散，反而犹如一条狡猾的鲶鱼，在小智的精神世界中肆意游走，不断制造混乱。
\"小智！\"小刚和小霞惊呼着冲向小智，试图给予帮助，却瞬间被胡地的超能力弹开。此时的小智，双眼一蓝一金，他竭尽全力去压制那股不断翻腾的金色意志。然而，作为高级超能力者的小智，其精神力终究是有限的。
就在小智即将被金色念力撕裂识海之际，一股强大的青蓝色超能力从小智的心口喷薄而出。伴随着超梦威严的咆哮，那股金色的意志仿佛受到了极大的惊吓，瞬间化作金色的液体，融入小智的精神世界。改写后的小说内容保持了原有的情节发展和设定，同时采用了更加生动、形象的表达方式，让读者更能感受到故事中的紧张气氛和角色们的情感变化。
与此同时，小智的超能力者天赋再次突破界限，其精神力量愈发深不可测，使他即将蜕变为超级超能力者，实力之强，几乎达到了与娜姿之父同等层次。
“呼——”小智深吸一口气，身体轻盈地悬浮于空中，仿佛不受地心引力的束缚。之后抹去额头的虚汗，才缓缓脚踏实地。
小智的状态虽令人赞叹，但也不得不承认，使用超能力固然炫酷拉风，却也耗费心神……
“小智，你没事吧？”小刚和小霞急忙奔至他身旁，面露关切之色。
小智摇头笑道：“我没事。幸好我是超能力者，否则今日或许真要栽在这胡地手上了。”他在心中默默感谢超梦的庇护。
小智深信，超梦一定能听见他的心声。
轰隆隆——！此时，两只巨大的宝可梦在久别重逢后展开激战。它们互相试探、激烈碰撞，释放出毁灭天地的能量。
望着眼前景象，小霞不禁吐槽道：“这么大的宝可梦，真是难以想象。”
而小刚则是绝望地呐喊：“看来这只胡地并不站在我们这一边，小智，我们该怎么办？”
无视周围环境的超古代胡地与超古代耿鬼，不断释放着毁灭性的攻击，二者在激烈的对抗中……
深邃的黑暗，如墨染透天际，璀璨的金色瞳孔，搅乱了周遭的气息。席卷世界的争斗，让人类束手无策，异界之门已在苍穹之上开启。此刻，怀特如梦初醒：“是他们，那两只宝可梦之间的争斗，导致了宝可梦文明的覆灭！”
“覆灭？”小刚和小霞面面相觑，满是不解。
“是的，”怀特继续道，“那两只超古代宝可梦被尊为神明，然而，他们之间的争斗，却无情地摧毁了一个繁荣的他们的脾气古怪，难以捉摸。”小智眼中闪烁着愤怒与绝望，同时抓紧图鉴的手也在颤抖着记录下这一切。
面对异界之门的降临，众人皆感束手无策。“我们该怎么办？只能眼睁睁地看着这一切发生吗？”怀特的声音中透露出绝望。
小智抬头仰望那扇通往异界的门，深吸一口气，他知道他必须站出来。“不要惊慌，”他沉稳地说，“我们已经有了应对之策。怀特，研究古代文明固然重要，但也要时刻保持警惕。”
怀特点点头，不知所措中透露出一种决心。
小智眼神坚定，瞬间移动至山坡上巨大的青铜鼎前。“现在，”他大喊一声，“无论我做什么，都请相信我！”
“我们知道！”小刚的声音坚定而有力，“快点行动吧！”
小智眼神犀利地看向异界之门。“我将跨越你的异界融合，走向我的精灵梦决定就是你，去吧胖丁！”命令声回荡在空气中。
“波叮~”催眠小曲的旋律响起，紧接着，漂亮登场的是那熟悉的耳塞。小智拍了拍手，宣告着治愈的时刻到来：“让声音唤醒安抚一切的力量吧。”
胖丁快乐地摆好姿势，歌声悠扬：“波波丁波，波波灵，穿越黑暗，唤醒光明。”随着胖丁治愈的歌声，两只超古代宝可梦虽然依旧不为所动，但小智背后，巨大的青铜钟闪耀着神秘的金色光芒。
此刻，仿佛有个声音在呼唤：“唱歌怎能忘记我？”超远古时代的歌者，大胖丁登场了！
从青铜钟中现身的巨大胖丁，引得小智赶紧取出图鉴记录这一刻。毕竟，它的歌声杀伤力，如同低音炮的震撼。
手持青铜麦克风，胖丁开始了低沉的吟唱。每一个音符都像是灵魂的震颤，驱散了黑暗，净化了心灵。两只超古代霸主在这歌声中痛苦地捂住耳朵，重新陷入沉睡。
收拾好胖丁，小智选择了一块平坦的地方休息。他取出龙王的鳞片，低声交代：“剩下的就交给你了，快龙。”
龙王鳞片闪烁着威严的光芒，随即一道空间裂缝在小智附近打开。一个巨大的橘黄色爪子从裂缝中伸出，将这三只远古精灵温柔地拖入其中。
终于，一切都结束了……