朱由哲得知济南城失陷的消息时正在泰安犒赏有功将士。
阿巴泰连续猛攻了三日，城池未破，清军损失颇大。
多尔衮以阿巴泰曾立下军令状为由要将之斩首示众，得诸将劝说，才停止。但是也借此夺了阿济格兵权，让他回盛京为努尔哈赤守灵。
用这样的方法狠狠打击了不听话的阿巴泰，同时震慑其他清军将领，挽救因阿济格身死而损伤的名声。
之后，多尔衮改变策略，不再强攻一面，而是将济南城四面围住。
依当时汇聚在济南城下的清军数量和战力而言，多尔衮的确可以做到。他下令每次在一面投入部分兵力攻城，而又不断改变攻城方向。
有时北门，有时南门，有时西门，有时东门。
而每次，多尔衮都令进攻清军全力进攻，而后续兵力更是严阵以待，做好随时全面攻城的准备，以此不断向明军施压。
不知道主攻方向，而感觉每次似乎都要城破，这逼的兵力本就不占优的明军只能不断跑着支援各处。
这种不断的撕扯持续了半个月，最后无论是兵力，还是身心，城中的明军都到达了极限。
最后，在多尔衮的倾力一击下，济南西门被攻破，清军杀入城中。
朱大典无力阻止，最后孤身返回了都督府，以前的大明德王府，自焚而死。
据清军说，朱大典自焚之时，房子里装满了金银。
大火烧化了金银，成块的金银变成了金水，银水，流的满地都是，最后只能用刀剑才能撬下来。
朱由哲对于这种说法当然是下旨极力反驳，说是清军污蔑。但内心却觉得，或许是事实。
朱大典不是个完美的将帅，他爱财，爱到了骨子里。
即使朱由哲三令五申，他依旧不断贪磨将士军饷。
但这样一个爱财之人，最后却殉国而死，而且是在他本来有机会提前撤离的情况下。
朱由哲只能感慨，人心还真是一件复杂的事物。
最后，朱由哲加封朱大典为太子少保，大明左都督，赐谥号“壮”，意指威武刚烈，死于原野。
在破城后，多尔衮在济南城中进行了大屠杀。
无论老少，是否投降，尽皆被杀。
多尔衮想通过这样的方式展示清军的实力，更是一种威慑，以削减阿济格兵败身死带来的影响。
济南城破没多久，朱由哲再次收到坏消息。
昌平城破。
在李过猛攻，和不断劝降下，城中有将领主动打开城门迎顺军入城。
昌平城破十日后，刘芳亮攻破通州，金声桓率部分轻骑突围，目前行踪不明。
京城，彻底沦为了一座孤城。
秋去冬来，天气愈加寒冷。
在顺军攻取昌平和通州之后，天下人的注意力都看向了京师。
朱由哲是，多尔衮也是。
而在这种情况下，双方在山东虽有小的冲突，但默契的没有爆发大战。
明军主动放弃了聊城，兖州，徐州，清军得到了大片领土。
除了前期，清军还派出轻骑追击明军外，后来都是清军看着明军撤离后才进入那些城池。
在明军主动放弃徐州，将主力撤回江淮后，多尔衮就知道自己不可能在短时间击破明军，杀入江南了。
在这种前提下，就也没必要和明军选择硬磕。
如果在和明军大战中损失过重，将来拿什么对抗李自成？
现在占据山东膏腴之地，将崇祯皇帝赶去贫瘠的登莱二州，而且还占据了南下的重要据点徐州。这种局面，对于清军来说，无疑是有利的。
所以，比起崇祯皇帝，多尔衮更愿意维持这种局面。
但双方的备战都没有停歇。
多尔衮将投靠汉卒编成绿营，让其维持清军所占地区内的基本局面。同时又从绿营中挑选精锐，组建新八旗。
按照多尔衮的说法，新八旗作为八旗的补充。
但凡八旗兵力有损失，便从新八旗挑选人选补充。
而绿营，新八旗，八旗的待遇完全不同，可以说是天差地别。
这就等于给了投靠汉卒一个向上的机会。
而这样的机会，则只有最精锐的战士才能获得。
这无疑能提高那些汉卒为大清战斗的激情。
而同时，多尔衮还在天津招募船工，组建水师。
虽然因为大量船只被朱由哲提前送去南地，但多尔衮还是得到了一些，只不过多是小船。
但朱由哲知道这个消息后，还是吃了一惊。
多尔衮在做南下的准备。
虽然不是现在，但也足以看出多尔衮此人的谋定而动。
这是一个可怕的对手。
而同样的，朱由哲也在做着准备。
他将衡王下的土地全部收为国有，以赏赐的方式分发给有功之臣。
而面对军中将士良莠不齐的情况，朱由哲对之进行了改编，尤其是王俊和张君尧二人手下的部队。
他们都是巨匪出身，手下人数众多，但战斗力低下。
从之前王俊在对战巩阿岱的过程中就可以看出，四万人马短短时间内折损了一大半。
朱由哲下令清除老弱，同时那种有一定战力，但是匪气太重的。
此举招致了很多不满，也使王俊、张君尧二人心中忐忑不已，以为他这是在秋后算账。
但等朱由哲亲自找二人谈过，并给二人补充了不少新卒后，他们心中的不安才略微减少。
而对于那些清除下来的兵卒，朱由哲也十分大方。
给田给粮给房。
虽不至于当个富家翁，但自此偶尔吃顿饱饭，在荒年不至饿死却是可以的。
同时，对士卒的训练也在不断加强，每支新兵都配属了一定数量的老兵，时时刻刻训练。
凡是表现优异者，都有赏，以此提高他们的积极性。
以前的，如白杆兵，可能因为损失了一些老兵而战斗力不如以前，但整个军队的战斗力却在迅速增强。
此外，朱由哲还花费大量精力在改进将士们的装备上。
燧发枪，火铳，火药，铠甲，弓箭，刀，枪等。
一切的一切都在加紧制作上。
而朱由哲的哭穷的诏书更是一封接着一封发向南地。