随后，二世就派了一个名叫曲宫的御史，带着诏令，驰往代郡。曲宫来到代郡，见到蒙毅后，出示诏令道：
先帝的决定是多么的英明睿智，现在朕承受天命继承大位，这是老天爷的意思。可是你从前阻挠先帝，不让册立朕为太子，是何原因朕认为你蒙蔽圣聪，不尽职守，不是忠臣。本来要灭你全族，朕实在不忍心，只赐你一死，对你的全族来说也算是庆幸的了。有什么话说给曲宫听，然后自裁。
蒙毅听罢，亦是当头棒喝，过了老半天才满腔愤慨地辩解道：“假如以前我不能博得先帝的欢心，那么我一直对先帝毕恭毕敬，顺意的蒙幸，直到先帝去世，可以说是最了解先帝的心意了。那时候，先帝从来都没有提起过要立陛下做太子，现在为什么突然说是我阻挠先帝立太子呢这一定是有人想诬陷我，如果把这个罪名强加到我的头上，这实在是有污先帝的声誉啊！因为先帝最了解他的臣子，我怎能让先帝落一个不识人的坏名声我究竟犯了何罪请你明示，这样即使我能为实情而死，也就瞑目了！”曲宫就从怀里取出了另一份帛书让蒙毅看。蒙毅打开一看，原来这份帛书是赵高写的：
蒙大人，当初我赵高犯了死罪，是你要我死吧那个时候你是座上客，我为阶下囚。你不救我，反要害我，你的心为什么如此狠毒多亏先帝英明才赦免我，恢复了我的职务，没想到我赵高福大命大。现在我是座上客，你是阶下囚，不过皇帝却不赦免你，我也没有办法，你好自为之。
蒙毅看罢，恍然大悟，才明白是怎么回事，大骂赵高道：“原来是这个无耻的小人诬陷我！我当初定他为死罪，是不敢徇私枉法，奉了先帝的诏令依法惩治他。这个奸贼，现在却公报私仇，先帝当初不应该赦免他啊！”蒙毅满腔悲愤的说着。曲宫在一旁催促他马上自杀。蒙毅悲痛地说：“我听古训说‘顺意成全，是正道所尊崇的；严刑杀戮，是正道所鄙弃的。’从前秦穆公用子车氏家的三良殉葬，昭襄王杀白起，楚平王杀伍奢，吴王杀伍子胥，这四位君王都是被后人唾弃的，所以圣明的君王不应该滥杀无辜。请你回去告诉陛下我说的话。”蒙毅说完，万分悲痛地接过曲宫的剑，面朝西方，大叫“先帝！我来了！”然后自刎而亡。
曲宫回朝报告。二世听说蒙毅死了，就想释放蒙恬。赵高得知这一情况，急派心腹来到阳周县提前来杀蒙恬。
蒙恬关押在阳周县的大牢，整天伤心流泪，期盼朝廷前来赦免。看守的牢卒劝慰道：“大将军为秦国立下了赫赫战功，是秦国的大功臣，过一段时间，朝廷一定会派人来赦免您。”时间不长，秦始皇驾崩的消息传到了阳周县。蒙恬听到这一消息，万分震惊。又过了几天，二世继位的消息传来。蒙恬此时才明白了是怎么回事了，他口中不停地为扶苏喊冤叫屈。牢卒问：“先帝驾崩，新皇帝即位，朝廷一定会赦免将军，您为什么不高兴”蒙恬叹气道：“你说错了，先帝若是活着，我一定不会死。现在先帝已经驾崩，胡亥即位，我的死期就到了啊！”牢卒问为什么。蒙恬回答：“先帝知道我的功劳，不可能杀我。胡亥即位一定是赵高的阴谋，因为赵高是胡亥的老师，他是易牙、竖刁一类的人物。自古以来小人得志，君子就要遭殃，这也是上苍安排好的。赵高是奸佞之人，丞相李斯偏袒用事，说不定也是同谋，朝廷又缺少以死诤谏的臣子，我秦国从此就完了！”蒙恬说完，又想起了扶苏临终时伤痛绝望的样子，心中如同刀绞。从此夜夜烦闷，寝食俱废。几天后，头发和胡须全白了。
忽然有一天，赵高的使者到了。使者见到蒙恬后，大声宣读矫诏说：
蒙将军，你的罪过真是太多了。你不死就是对朕不忠，你的弟弟蒙毅已经畏罪自杀，将军为什么还想不通啊你难道还想把灾祸带给你的族人吗现在朕赐你马上自裁，以保全族人，这对将军来说，确实是幸运的事情。
蒙恬听了使者的话，异常悲愤道：“从我的先人到我这一代，都为秦国立下汗马功劳。我曾经带甲数十万打败北方的匈奴人，现在身体虽然被囚禁，但我蒙恬的声名依然还威震北方。我开始听到先帝要杀我，就非常怀疑，劝扶苏不要中了奸人之计，马上做出重大行动，仿效鲍叔牙、管夷吾之事，想拥立扶苏即位。可是扶苏仁慈善良，不听我的忠告。他无非是因为不敢忘怀先帝的恩德，也不敢辱没祖先们的名声。现在新皇帝即位了，君臣的名份也已经确定，我怎敢再有二心我听说古时候，周成王年幼，周公旦披着斗篷处理国政，他身体力行，忠心耿耿地为国家谋划。成王得病的时候，就到河上祷告上苍，代为疾体，并且写了信藏在家中。后来有人向成王进谗，说周公旦想要篡夺王位。周成王听信谗言，就想治周公的罪，周公只好逃跑。后来成王在周公旦的家中发现了金藤藏书，看后非常感动，才知道周公旦是位忠臣，就杀了进谗言的人，重新把周公迎接到宫中，周朝的江山才得以安定。现在我蒙恬忠心耿耿，对陛下没有二心。只恨赵高这个奸贼，害死了仁慈善良的扶苏，现在又来杀我，我非常痛恨他。我听说：夏桀王杀死关龙逢，商纣王杀死比干，都是由于亲近小人，远离贤臣才导致国家败亡。我虽然要死了，可是‘人之将死，其言也善；鸟之将亡，其鸣也哀。’我一心要给陛下进呈忠言，这样做不是为了乞求陛下赦免我，而是因为仰慕从前的臣子以死诤谏的风尚啊！所以请求使者大人向陛下申诉我的忠诚，蒙恬死而无憾！”
使者听了这话，非常感动，只好说：“我知道将军的功劳，也知道您是冤枉的，但我不敢向陛下汇报，只能按赵大人的吩咐行事，请将军见凉啊！”蒙恬见再也无法向新皇帝申辩，仰天长叹数声，忿怒的大吼：“苍天啊！苍天！我蒙恬有什么罪”又低头沉思了半晌，自言自语地说：“我有罪！我有罪啊老天爷！我以前率领几十万百姓修建长城，难免开山凿地，斩断了龙脉旺气而获罪于上苍啊！这就是我蒙恬的罪过了！我死有余辜！死有余辜！”说完悲愤地接过使者的剑，绝望地自杀了。有诗叹道：
防胡兴土木，外宁内先讧。
若得将军在，胜过万里城。
蒙恬死后，赵高得到报告，非常高兴。就立即入朝向二世汇报说：“从阳周县回来的官吏说，蒙恬听说陛下要赦免他，反而觉得悔恨不已，痛哭了一夜，第二天就自杀了。临死说不该在先帝面前说陛下的坏话，而有负先帝的知遇之恩。”二世听说蒙恬已死，心里惋惜了半天，叹道：“没想到，大将军功劳盖世，现在却畏罪自杀了，这是秦国的损失啊！”
从此以后，二世在赵高的怂恿下，胡作非为，只顾享乐，朝政一天天混乱起来。