6月，刘奭接受长信少府贡禹的建议，罢免甘泉宫、建章宫的卫士，令他们回乡务农。
6月，刘奭命丞相、御史各推荐天下明阴阳灾异者3人。
本年，刘奭重新起用周堪，任命他为光禄勋、周堪的弟子、张骞之孙张猛为光禄大夫、给事中。大加信任。
初元4年（bc45）1月，刘奭行幸甘泉，郊祀泰畤。3月，刘奭行幸河东郡，祭祠后土。赦免汾阴囚徒。赐民爵一级，女子每百户牛酒，鳏寡孤独及年老者等社会弱势群体帛。免除所经郡国今年的租赋。
初元5年（bc44）1月，汉元帝刘奭封姬嘉之孙、周子南君姬延为周承休侯。位在诸侯王之下。
3月，刘奭行幸雍地，祭祠五畤。
4月，有星孛于参。刘奭接受贡禹等儒生们的意见，下诏罢免角抵官、上林宫馆中未被御幸者、齐三服官、北假田官、盐铁官、常平仓；不限博士弟子的名额，以广学者。赐宗室子有属籍者马；三老、孝者每人帛5匹；悌者、力田者每人帛3匹；鳏寡孤独者每人帛2匹。官吏百姓每50户牛酒。省刑罚70余事。
御史大夫陈万年去世。6月20日，长信少府贡禹升任御史大夫。12月9日去世。19日，长信少府薛广德升任御史大夫。
一想到汉朝，郅支单于就悲从中来。他突然想起：自己还有个儿子驹于利受在汉朝做人质呢。以为把儿子送过去了，汉朝要帮也得帮两边，至少也要当个和事佬？可现在汉朝只帮呼韩邪单于，自己还亏了一个儿子，这算哪门子生意呢？
于是，郅支单于也扣押了江乃始等汉使，派人向汉朝说：既双方生意不行，麻烦你们把我的儿子送回来！
当初，郅支单于送儿子来长安当人质的时候，接收人是汉宣帝刘询。转眼多年过去，刘询已驾崩，现任皇帝是刘奭。刘奭这个人向来好说话，他二话不说，决定把人家的儿子送还给人家…
但怎么送，汉朝内部却起了争执。
御史大夫贡禹、博士匡衡认为：郅支单于此人狼子野心，不知心里打的什么算盘。为安全起见，还是只送到塞外的好。
另一派则认为不行。汉朝替郅支单于养了多年的儿子，多少也是有感情的。现在孩子大了，只送他到塞外，会伤害到孩子脆弱的心灵，以后他可能连我们都不认了，所以还是把他送到郅支单于本部吧，我们手里握着汉朝的符节，谅郅支单于也不敢怎么样。如真怎么样了，他就别想呆在那里，等着逃亡吧。
大多数人认同第一种方案，只有一个人赞成第二种方案：卫司马谷吉！同时他还表示：护卫太子的任务，就包在我身上好了！
提方案的人是他，要去送死的人也是他，别人争了一番，好像也觉得没啥意思？最后汉元帝刘奭拍板：就让谷吉把郅支单于的儿子，送到他的新王庭坚昆。
真是担心啥就来啥。当谷吉万里迢迢地把儿子送到郅支单于面前时，人家却连一句感谢的话都没有，直接拉出去就砍了！
匈奴历史上，胆敢杀汉朝使节的单于，都是没好下场的！如你真敢杀，汉朝大军马上就会开到你家门前！
但郅支单于杀谷吉的时候，想到的只是汉朝对呼韩邪的好、对他的坏
。但当他把谷吉杀了以后，突然拍拍脑袋，不禁叫道：闯祸了、坏事了！
纸是包不住火的，如汉朝没看到使者回来，肯定会派人来要。那时肯定就露陷了。那怎么办？郅支单于现在的脑袋很灵光：此时不跑，更待何时。
要跑，也要找个好地方跑呀！跑哪里才安全呢？一想到这，郅支单于突然焉了。想来想去，天地之大，竟没他的藏身之处？正当郅支单于走投无路之时，突然有人给他伸来了一根橄榄枝，让郅支单于一下子从地狱跃到了天堂！
给郅支单于伸出橄榄枝的人，是康居国王。
在遥远的西边，康居国正在被乌孙国欺负，康居国王突然想到了郅支单于，于是便派人去告诉郅支单于：你来帮我吧。只要我们联手摆平乌孙，他的就是你的，我的也是你的…
做梦都没想到，天上会掉下这等好买卖！买卖好，但成本也大。郅支单于率领军队向西开拔。终于抵达了康居国。代价是惨重的：他的部队只剩下三千多人，其余的都在路上当了冻死鬼！
康居国王很守信，热情款待了郅于单于。为显示诚意，还把自己女儿嫁给了郅支单于、郅支单于也把自己女儿嫁给了康居国王，两家互为翁婿。
接着，郅支单于就率领匈、康联军，向乌孙国大举进攻！一直攻破了乌孙国都赤谷城，实行了三光政策：杀光、抢光、烧光！
曾经美丽的乌孙国，茫茫五千里，竟找不到一个人迹、看不到一缕人间烟火…
永光元年（bc43）1月，刘奭行幸甘泉，郊祀泰畤。赦云阳囚徒。赐民爵一级，女子每百户牛酒，老年人帛，免除所经郡国今年租赋。祭礼完毕后，刘奭还想留下来射猎。御史大夫薛广德上书进谏，刘奭总算听从，立命还宫。
3月，雨雪霜灾，杀桑。刘奭下诏罪己。大赦天下。给贫民赈贷种子、粮食。赐六百石以上吏五大夫爵位、勤事吏二级爵位、天下民爵一级、女子每百户牛酒、鳏寡孤独及年老者等社会弱势群体帛。
4月，日黑居仄，大如弹丸。这应是世界上最早的有关太阳黑子的记载（不过世界公认的记载还是在15年后的汉成帝河平元年）
秋天，汉元帝刘奭往祭宗庙，从便门出发，欲乘楼船。御史大夫薛广德拦住乘舆，免冠顿首进谏“陛下宜过桥，不宜乘船”刘奭命左右传谕“可带冠”薛广德却道“陛下若不听臣，臣当自刎，以血染污车轮，陛下恐不得入庙矣”刘奭正郁闷中，光禄大夫张猛上前“主圣才有臣直。乘船危险，走桥安全。陛下应该听御史大夫的意见”刘奭这才转怒为喜，命摆驾过桥。
9月，霜灾，庄稼歉收，天下大饥。丞相于定国、大司马兼车骑将军史高、御史大夫薛广德，这三位朝廷最高的三公高官集体引咎辞职。汉元帝刘奭各赐安车、驷马、黄金60斤，准令还家，三人并得寿终。
24日，刘奭任命自己祖母王夫人的长兄王无故之子王接为大司马、车骑将军。对御史大夫的人选，刘奭本想安排孔子的第13代孙、曾教授自己《尚书》的老师孔霸来担任。但孔霸只接受了关内侯的爵位，号褒成君、给事中的官职。而对丞相或御史大夫之位屡次谦退不受。刘奭便只能任命太子太傅韦玄成为御史大夫。
石显整死萧望之、整废刘向之后，却没想到刘奭又把周堪及其弟子张猛召回朝中，大加信任
。不行！必须再搞掉这两个人，朝中才能唯我独尊！
这时已被贬为庶人的刘向也意识到了危险，隐忍不住，又写了一封洋洋洒洒数千言的上书，送进皇宫。奏章中列举了记载在经典之上的种种灾异变迁，作为警戒。归根到底一句话：请陛下您要亲贤臣，远小人！
没有意外，石显仍是此封上书的第一读者。越读越怒，但转念一想：刘向如今已是庶民一个，不必怕他。现在重要的是要将周堪、张猛二人除去！于是约同许、史两家外戚子弟，待畔而动…
正碰上本年夏天天寒，日青无光。正好以人之矛，攻人之盾。石显与许、史子弟纷纷进谗说：此天变都是周堪、张猛擅权用事所致。刘奭正信任周堪，不肯轻信。哪知满朝公卿又接连呈入奏章，争相弹劾二人，弄得皇帝将信将疑。
长安令杨兴以小材得蒙宠幸，平时入见，常称誉周堪忠直。有一次刘奭便问杨兴“朝臣多说光禄勋周老师的坏话，这到底是为什么呀”杨兴生性刁滑，听了此问，便认为皇帝有意罢免周堪，于是道“光禄勋大人不但朝廷难容，即便退居乡里亦不容也。众人弹劾周堪、刘向等人谋毁骨肉，罪应加诛。只是臣认为周堪毕竟做过陛下的老师，出于尊师重道，臣才说陛下不宜杀周堪，却绝非推重此人呢”刘奭点点头“那你说：现在该怎么办”杨兴答“可赐爵关内侯，食邑三百户，但不让他再参与朝廷政事”
杨兴出去后，刘奭更加左右为难。这时，城门校尉诸葛丰的弹劾奏章，成了压垮周堪、张猛的最后一根稻草！
诸葛丰本是司隶校尉，秉性刚直，不避权贵，打击豪强。后来打击到了外戚许章的身上，被汉元帝刘奭以“专擅无礼”的罪名将诸葛丰降为城门校尉。诸葛丰很是气愤，满望周堪、张猛二人能替自己申冤，但好几日都不见音信。不由恨上加恨，认为周、张二人也是落井下石的小人。因此平时常称誉二人，至此反列入弹章。
只是诸葛丰自己也没想到：伤人一千，自损八百。诸葛丰被刘奭贬为庶人，连城门校尉也没的做了。同时，周堪被外放为河东郡太守、张猛为右扶风槐里县令。
周堪、张猛被贬，石显权焰更甚。他的下一个整人目标又会是谁呢？
贾谊曾孙贾捐之4年前曾上书建议汉元帝放弃珠崖郡，得到当时丞相于定国、皇帝刘奭的首肯。可即便如此，因他数次反对石显，所以至今不得一官。
求官无门的贾捐之听说长安令杨兴如今是皇帝身边的红人，就主动上门结交，两人成为好友。正逢京兆尹出缺，贾捐之便对杨兴道“你的才能足以胜任京兆尹。若使我能够见到陛下，必然竭力保荐”杨兴则道“你的文笔甲天下，最适合当尚书令了，绝对比现在石显推荐的那个五鹿充宗要强上无数倍”贾捐之大笑道“京兆乃郡国之首、尚书是百官之本。若你做京兆尹、我当尚书令，这天下何愁不大治”
然而杨兴此时却说了一句话“只不过要达成我们这个愿望，就要见到皇帝。可是你知道吗？如今要见皇帝，非得打通中书令的关节不可啊”贾捐之不禁愕然“中书令石显？我怎么可能去巴结他一个太监”杨兴道“话不是这样说。为了你我的大计，只有去求石显这一条路。老兄还是委屈点吧”
求官心急的贾捐之也只能与杨兴联名上书，保荐石显为关内侯、石显的兄弟们为诸曹官。同时再加上贾捐之保荐杨兴为京兆尹的奏疏，两封奏章一起送进皇宫…
毫无疑问，石显仍是奏章的第一读者。石显已知两人之密谋，便奏请皇帝，将二人下狱。最后以“更相荐誉，欲得大位，罔上不道”的罪名判贾捐之弃市、杨兴减死一等，髡钳为城旦。