上募兵毕竟是上募兵，李子通部的万余步卒一时之间竟奈何杜伏威的两千上募兵不得。但是杜伏威面对黑压压的叛军，也放弃了去斩杀李子通这不切实际的想法。
上募兵奋勇拼杀，护卫着杜伏威向城外冲去。杜伏威本人也手持一柄长矛，左右刺杀，不多时刻，他就血染战袍。上募兵也不断的因中箭，被捅刺，被劈砍倒毙在血泊之中。李子通的叛军则是死的更多，东倒西歪的尸体铺满了青石板大街。
杜伏威终究是杀开了一条血路，一行人冲到西城门。冲在最前面的上募兵已经控制了城门和城楼。城门被打开，吊桥已被放下，杜伏威毫不犹豫的策马向外奔去。
他刚一出城门，心就如同坠到冰窟里一般，因为前方出现了大批兵马，杜伏威以为是李子通前来围剿自己的其余人马。他大吼一声：“难道老子我今天就要丧生此处了吗！”
此时，对方军阵之中驰出一将，他策马到了杜伏威部的近前，满眼惊诧的看着浑身是血，正向外奔逃的上募兵卒们，猛然他看到了杜伏威。连忙上前拱手手道：“大将军，您这是怎么了。为何如此光景。”
杜伏威这才看清，来将正是西门君仪。他心中大喜，连忙说道：“西门，你来的正好。李子通这贼秃他娘的叛变了。随我杀回城中，老子要亲手宰了这狗日的。”
西门君仪听后，连忙指挥身后的五千多人马跟随杜伏威再次返身杀回六合城中。
城内的李子通正为杜伏威跑了而气恼不己，做梦也没想到杜伏威立刻就带着一支援军反攻了。正要出城追击的叛军猝不及防中，被突然返身而攻的上募兵纷纷斩杀在地。
杜伏威与西门君仪的大军蜂拥入城。李子通部刚才在围剿杜伏威的战斗中已经损失惨重，士气消散。又猝不及防的被人反击，顿时兵士们纷纷败走。
相反，杜伏威以及西门君仪的兵卒却士气旺盛，杜伏威的上募兵士气高涨是因为有了为死去兄弟报仇的机会，西门所带的兵卒是期望攻下六合后好吃大睡一顿，因此人人奋勇拼杀。
战斗进行了大半个时辰，李子通部就已成全面溃败之势。李子通见大势不妙，连忙带着两三千亲兵向东门外撤去。杜伏威又苦战半个时辰，消灭了李子通残余，才算是控制住了六合全城。
杜伏威再次清点人马，发现仅剩下五千人不到，其中有千余人是上募兵。他将兵马稍加休整后，想到件大事。迅速找来西门君仪，要他用此前的兵符，调集六合郡的所有杜伏威部来六合县集结待命。他怕李子通抢先将这些部队拉走。西门君仪领命而去。
到了下午时分，西门军仪带来个不好的消息。六合郡的三万兵马都被李子通以六合督军司马的名义全部带走。
原来李子通早有布置，六合郡的兵马主力全都被他事先集中在六合以东一个军营中，上午逃窜经过那时，顺路就带走了这些兵力，另外又顺道带走几个县城的驻军，往高邮而去。
杜伏威心里咯噔一下，说道。这李子通带着大军向高邮而去，显然是打高邮的主意。而高邮方面的守军还不知道他叛变的消息，李子通可以很容易骗过高邮守将，发动奇袭，吞并高邮的守军。
此时的李子通正在高邮与六合交界处的永福县“整编”军队。此时他才公开了和杜伏威决裂的消息。那些被他骗到此处的原杜伏威部惊诧无比，但是这些部队亲杜伏威的头领此时皆被李子通斩杀，头颅尸体都堆积在位于永福县主街正中的菜市场上。普通兵卒和底层小头目慑于李子通的威势，即使心中不愿意，也不敢表『露』出来和公开反对。
很快，他就将这些部队的将校全部安『插』为自己的亲信。李子通清楚，这永福县绝非自己久留之地。东北面的高邮还分屯有杜伏威的三万大军，若是杜伏威与他们取得联系东西夹击自己，围攻永福，自己也难逃覆灭的下场。
于是，李子通己打定主意，急令全军向高邮进发。他想如法炮制，将杜伏威高邮的部队也给吞并了。而后长期盘踞高邮，这高邮东扼邗沟，北临淮河，境内沟壑纵横，芦苇丛生，正是用兵之所在。
就在李子通抵达高邮之时，杜伏威派往高邮的快马也将信笺送到高邮守将手中。李子通的计策自然是没有得逞，双方随即爆发战斗。这一仗持续了整整十五天，双方大小接战十余场，最终李子通部坚持不住，三万临时拼凑起来的大军逐渐溃散，李子通只好率着本部兵马向淮河以北败逃。高邮的杜伏威部守军虽胜，亦有很大伤亡。
恰恰在这个时候，杨广令江都的隋军对高邮发起猛烈进攻。桨帆战舰顺着邗沟驶入高邮境内各个湖泊，隋军精锐，两万骁果军战兵步卒倾巢出动向高邮各县发起全面进攻，除此还有五万驻守江都的其余隋军配合。杨广甚至出动了天兴军的山地长枪兵和长弓手。
已经损耗严重的杜伏威部高邮守军哪能抵抗的了如此猛烈进攻。抵抗了数天后就全线溃败。三万贼军大部分被歼灭，少部分逃向六合。此时，陈俊又加强了六合县北面的盱胎县兵力，形成对六合的合围之势。
六合县城的府衙庭院内，杜伏威看着阴霾的天空，眉头紧锁的发着呆。如今他的实力大损，所有兵力加起来不到万人，而且先后损失多名大将，李子通叛变，这些给他的打击不小。
以前，他不是没遇到过这种情况，最终还是克服难关，挺过来了，不仅没灭亡，反而茁壮成长起来。但今时不比往日了，这隋军显然实力士气都大大高于此前，最重要的是民心似乎倒向了隋朝那边，自己募兵都困难了许多。他知道这是罪己诏的效果，皇帝以诏书的形式表明了悔过的态度，保证不再随意耗费民力，并且许诺之前征役民力过度的地区免税三年。